Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gjb2Q00977 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Gjb2Q00977 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Gjb2Q00977 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gjb2Q00977 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gjb2Q00977 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Gjb2Q00977 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gjb2Q00977 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gjb2Q00977 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gjb2Q00977 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gjb2Q00977 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gjb2Q00977 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gjb2Q00977 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gjb2Q00977 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gjb2Q00977 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gjb2Q00977 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gjb2Q00977 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gjb2Q00977 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gjb2Q00977 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gjb2Q00977 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gjb2Q00977 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gjb2Q00977 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gjb2Q00977 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gjb2Q00977 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gjb2Q00977 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gjb2Q00977 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gjb2Q00977 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gjb2Q00977 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gjb2Q00977 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gjb2Q00977 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gjb2Q00977 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gjb2Q00977 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gjb2Q00977 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gjb2Q00977 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gjb2Q00977 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gjb2Q00977 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gjb2Q00977 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gjb2Q00977 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gjb2Q00977 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gjb2Q00977 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gjb2Q00977 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gjb2Q00977 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gjb2Q00977 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gjb2Q00977 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gjb2Q00977 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gjb2Q00977 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gjb2Q00977 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gjb2Q00977 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gjb2Q00977 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gjb2Q00977 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gjb2Q00977 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gjb2Q00977 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Gjb2Q00977 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Gjb2Q00977 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gjb2Q00977 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Gjb2Q00977 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gjb2Q00977 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gjb2Q00977 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gjb2Q00977 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gjb2Q00977 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gjb2Q00977 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gjb2Q00977 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gjb2Q00977 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gjb2Q00977 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gjb2Q00977 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gjb2Q00977 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gjb2Q00977 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gjb2Q00977 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gjb2Q00977 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gjb2Q00977 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gjb2Q00977 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gjb2Q00977 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gjb2Q00977 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gjb2Q00977 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gjb2Q00977 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gjb2Q00977 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gjb2Q00977 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gjb2Q00977 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gjb2Q00977 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gjb2Q00977 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gjb2Q00977 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gjb2Q00977 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gjb2Q00977 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gjb2Q00977 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gjb2Q00977 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gjb2Q00977 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gjb2Q00977 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gjb2Q00977 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gjb2Q00977 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gjb2Q00977 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Gjb2Q00977 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gjb2Q00977 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gjb2Q00977 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gjb2Q00977 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gjb2Q00977 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gjb2Q00977 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gjb2Q00977 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gjb2Q00977 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gjb2Q00977 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gjb2Q00977 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms