Protein–RNA interactions for Protein: Q00898

Serpina1e, Alpha-1-antitrypsin 1-5, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1eQ00898 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Serpina1eQ00898 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Serpina1eQ00898 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Serpina1eQ00898 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Serpina1eQ00898 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Serpina1eQ00898 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Serpina1eQ00898 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Serpina1eQ00898 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Serpina1eQ00898 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Serpina1eQ00898 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Serpina1eQ00898 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Serpina1eQ00898 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Serpina1eQ00898 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Serpina1eQ00898 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Serpina1eQ00898 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Serpina1eQ00898 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Serpina1eQ00898 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Serpina1eQ00898 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Serpina1eQ00898 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Serpina1eQ00898 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Serpina1eQ00898 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Serpina1eQ00898 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Serpina1eQ00898 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Serpina1eQ00898 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Serpina1eQ00898 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Serpina1eQ00898 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Serpina1eQ00898 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Serpina1eQ00898 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Serpina1eQ00898 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Serpina1eQ00898 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Serpina1eQ00898 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Serpina1eQ00898 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Serpina1eQ00898 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Serpina1eQ00898 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Serpina1eQ00898 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Serpina1eQ00898 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Serpina1eQ00898 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Serpina1eQ00898 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Serpina1eQ00898 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Serpina1eQ00898 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Serpina1eQ00898 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Serpina1eQ00898 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Serpina1eQ00898 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Serpina1eQ00898 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Serpina1eQ00898 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Serpina1eQ00898 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Serpina1eQ00898 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Serpina1eQ00898 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Serpina1eQ00898 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Serpina1eQ00898 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Serpina1eQ00898 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Serpina1eQ00898 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Serpina1eQ00898 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Serpina1eQ00898 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Serpina1eQ00898 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Serpina1eQ00898 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Serpina1eQ00898 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Serpina1eQ00898 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Serpina1eQ00898 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Serpina1eQ00898 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Serpina1eQ00898 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Serpina1eQ00898 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Serpina1eQ00898 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Serpina1eQ00898 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Serpina1eQ00898 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Serpina1eQ00898 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Serpina1eQ00898 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Serpina1eQ00898 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Serpina1eQ00898 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Serpina1eQ00898 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Serpina1eQ00898 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Serpina1eQ00898 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Serpina1eQ00898 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Serpina1eQ00898 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Serpina1eQ00898 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Serpina1eQ00898 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Serpina1eQ00898 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Serpina1eQ00898 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Serpina1eQ00898 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Serpina1eQ00898 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Serpina1eQ00898 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Serpina1eQ00898 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Serpina1eQ00898 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Serpina1eQ00898 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Serpina1eQ00898 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Serpina1eQ00898 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Serpina1eQ00898 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Serpina1eQ00898 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Serpina1eQ00898 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Serpina1eQ00898 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Serpina1eQ00898 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Serpina1eQ00898 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Serpina1eQ00898 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Serpina1eQ00898 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Serpina1eQ00898 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Serpina1eQ00898 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Serpina1eQ00898 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Serpina1eQ00898 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Serpina1eQ00898 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Serpina1eQ00898 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms