Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbp4Q00724 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbp4Q00724 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbp4Q00724 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbp4Q00724 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbp4Q00724 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbp4Q00724 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbp4Q00724 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbp4Q00724 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rbp4Q00724 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rbp4Q00724 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rbp4Q00724 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rbp4Q00724 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbp4Q00724 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbp4Q00724 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbp4Q00724 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbp4Q00724 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbp4Q00724 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbp4Q00724 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbp4Q00724 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbp4Q00724 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbp4Q00724 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbp4Q00724 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbp4Q00724 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbp4Q00724 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbp4Q00724 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbp4Q00724 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbp4Q00724 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbp4Q00724 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbp4Q00724 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbp4Q00724 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbp4Q00724 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbp4Q00724 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbp4Q00724 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbp4Q00724 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbp4Q00724 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbp4Q00724 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbp4Q00724 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbp4Q00724 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbp4Q00724 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbp4Q00724 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbp4Q00724 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbp4Q00724 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbp4Q00724 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbp4Q00724 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbp4Q00724 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbp4Q00724 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbp4Q00724 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbp4Q00724 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbp4Q00724 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbp4Q00724 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbp4Q00724 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbp4Q00724 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbp4Q00724 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbp4Q00724 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbp4Q00724 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbp4Q00724 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbp4Q00724 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbp4Q00724 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbp4Q00724 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbp4Q00724 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbp4Q00724 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbp4Q00724 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbp4Q00724 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbp4Q00724 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbp4Q00724 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbp4Q00724 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbp4Q00724 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbp4Q00724 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbp4Q00724 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbp4Q00724 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbp4Q00724 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbp4Q00724 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbp4Q00724 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbp4Q00724 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbp4Q00724 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbp4Q00724 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbp4Q00724 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbp4Q00724 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbp4Q00724 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbp4Q00724 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbp4Q00724 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbp4Q00724 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbp4Q00724 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbp4Q00724 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbp4Q00724 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbp4Q00724 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbp4Q00724 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbp4Q00724 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbp4Q00724 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbp4Q00724 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbp4Q00724 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbp4Q00724 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbp4Q00724 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbp4Q00724 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbp4Q00724 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbp4Q00724 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbp4Q00724 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbp4Q00724 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbp4Q00724 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms