Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itga4Q00651 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itga4Q00651 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itga4Q00651 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itga4Q00651 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itga4Q00651 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itga4Q00651 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itga4Q00651 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itga4Q00651 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itga4Q00651 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itga4Q00651 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itga4Q00651 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itga4Q00651 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itga4Q00651 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itga4Q00651 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Itga4Q00651 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itga4Q00651 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itga4Q00651 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Itga4Q00651 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itga4Q00651 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itga4Q00651 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itga4Q00651 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itga4Q00651 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itga4Q00651 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itga4Q00651 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itga4Q00651 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itga4Q00651 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itga4Q00651 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itga4Q00651 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Itga4Q00651 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itga4Q00651 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itga4Q00651 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itga4Q00651 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itga4Q00651 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itga4Q00651 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itga4Q00651 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itga4Q00651 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Itga4Q00651 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itga4Q00651 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itga4Q00651 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itga4Q00651 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itga4Q00651 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itga4Q00651 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itga4Q00651 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Itga4Q00651 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itga4Q00651 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itga4Q00651 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itga4Q00651 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Itga4Q00651 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itga4Q00651 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itga4Q00651 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itga4Q00651 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itga4Q00651 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itga4Q00651 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itga4Q00651 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Itga4Q00651 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itga4Q00651 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itga4Q00651 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itga4Q00651 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itga4Q00651 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itga4Q00651 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itga4Q00651 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itga4Q00651 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Itga4Q00651 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Itga4Q00651 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itga4Q00651 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itga4Q00651 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itga4Q00651 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itga4Q00651 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itga4Q00651 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itga4Q00651 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Itga4Q00651 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itga4Q00651 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itga4Q00651 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Itga4Q00651 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itga4Q00651 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itga4Q00651 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itga4Q00651 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itga4Q00651 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itga4Q00651 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itga4Q00651 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itga4Q00651 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Itga4Q00651 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itga4Q00651 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itga4Q00651 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itga4Q00651 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itga4Q00651 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itga4Q00651 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itga4Q00651 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itga4Q00651 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Itga4Q00651 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itga4Q00651 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itga4Q00651 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itga4Q00651 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itga4Q00651 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itga4Q00651 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itga4Q00651 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itga4Q00651 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itga4Q00651 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itga4Q00651 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms