Protein–RNA interactions for Protein: Q00560

Il6st, Interleukin-6 receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Il6stQ00560 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Il6stQ00560 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Il6stQ00560 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Il6stQ00560 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Il6stQ00560 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Il6stQ00560 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Il6stQ00560 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Il6stQ00560 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Il6stQ00560 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Il6stQ00560 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Il6stQ00560 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Il6stQ00560 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Il6stQ00560 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Il6stQ00560 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Il6stQ00560 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Il6stQ00560 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Il6stQ00560 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Il6stQ00560 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Il6stQ00560 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Il6stQ00560 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Il6stQ00560 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Il6stQ00560 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Il6stQ00560 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Il6stQ00560 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Il6stQ00560 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Il6stQ00560 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Il6stQ00560 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Il6stQ00560 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Il6stQ00560 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Il6stQ00560 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Il6stQ00560 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Il6stQ00560 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Il6stQ00560 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Il6stQ00560 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Il6stQ00560 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Il6stQ00560 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Il6stQ00560 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Il6stQ00560 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Il6stQ00560 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Il6stQ00560 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Il6stQ00560 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Il6stQ00560 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Il6stQ00560 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Il6stQ00560 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Il6stQ00560 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Il6stQ00560 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Il6stQ00560 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Il6stQ00560 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Il6stQ00560 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Il6stQ00560 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Il6stQ00560 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Il6stQ00560 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Il6stQ00560 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Il6stQ00560 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Il6stQ00560 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Il6stQ00560 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Il6stQ00560 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Il6stQ00560 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Il6stQ00560 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Il6stQ00560 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Il6stQ00560 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Il6stQ00560 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Il6stQ00560 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Il6stQ00560 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms