Protein–RNA interactions for Protein: Q00560

Il6st, Interleukin-6 receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Il6stQ00560 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Il6stQ00560 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Il6stQ00560 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Il6stQ00560 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Il6stQ00560 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Il6stQ00560 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Il6stQ00560 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Il6stQ00560 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Il6stQ00560 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Il6stQ00560 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Il6stQ00560 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Il6stQ00560 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Il6stQ00560 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Il6stQ00560 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Il6stQ00560 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Il6stQ00560 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Il6stQ00560 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Il6stQ00560 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Il6stQ00560 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Il6stQ00560 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Il6stQ00560 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Il6stQ00560 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Il6stQ00560 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Il6stQ00560 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Il6stQ00560 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Il6stQ00560 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Il6stQ00560 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Il6stQ00560 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Il6stQ00560 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Il6stQ00560 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Il6stQ00560 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Il6stQ00560 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Il6stQ00560 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Il6stQ00560 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Il6stQ00560 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Il6stQ00560 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Il6stQ00560 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Il6stQ00560 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Il6stQ00560 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Il6stQ00560 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Il6stQ00560 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Il6stQ00560 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Il6stQ00560 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Il6stQ00560 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Il6stQ00560 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Il6stQ00560 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Il6stQ00560 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Il6stQ00560 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Il6stQ00560 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Il6stQ00560 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Il6stQ00560 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Il6stQ00560 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Il6stQ00560 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Il6stQ00560 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Il6stQ00560 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Il6stQ00560 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Il6stQ00560 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Il6stQ00560 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Il6stQ00560 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Il6stQ00560 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Il6stQ00560 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Il6stQ00560 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Il6stQ00560 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Il6stQ00560 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Il6stQ00560 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.4 ms