Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pax8Q00288 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pax8Q00288 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pax8Q00288 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pax8Q00288 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pax8Q00288 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pax8Q00288 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pax8Q00288 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pax8Q00288 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pax8Q00288 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pax8Q00288 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pax8Q00288 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pax8Q00288 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pax8Q00288 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pax8Q00288 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pax8Q00288 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pax8Q00288 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pax8Q00288 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pax8Q00288 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pax8Q00288 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pax8Q00288 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pax8Q00288 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pax8Q00288 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Pax8Q00288 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pax8Q00288 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pax8Q00288 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pax8Q00288 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pax8Q00288 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pax8Q00288 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pax8Q00288 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pax8Q00288 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Pax8Q00288 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pax8Q00288 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pax8Q00288 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pax8Q00288 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pax8Q00288 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pax8Q00288 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pax8Q00288 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pax8Q00288 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pax8Q00288 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pax8Q00288 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pax8Q00288 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pax8Q00288 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pax8Q00288 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pax8Q00288 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pax8Q00288 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pax8Q00288 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pax8Q00288 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pax8Q00288 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pax8Q00288 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pax8Q00288 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pax8Q00288 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pax8Q00288 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pax8Q00288 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pax8Q00288 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pax8Q00288 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pax8Q00288 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pax8Q00288 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pax8Q00288 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pax8Q00288 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pax8Q00288 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pax8Q00288 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pax8Q00288 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pax8Q00288 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pax8Q00288 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pax8Q00288 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pax8Q00288 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pax8Q00288 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pax8Q00288 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pax8Q00288 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pax8Q00288 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Pax8Q00288 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pax8Q00288 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pax8Q00288 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pax8Q00288 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pax8Q00288 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pax8Q00288 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pax8Q00288 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pax8Q00288 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pax8Q00288 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pax8Q00288 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pax8Q00288 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pax8Q00288 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pax8Q00288 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pax8Q00288 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pax8Q00288 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pax8Q00288 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pax8Q00288 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pax8Q00288 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pax8Q00288 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pax8Q00288 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pax8Q00288 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pax8Q00288 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pax8Q00288 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pax8Q00288 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pax8Q00288 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pax8Q00288 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pax8Q00288 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pax8Q00288 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pax8Q00288 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms