Protein–RNA interactions for Protein: Q00175

Pgr, Progesterone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgrQ00175 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PgrQ00175 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PgrQ00175 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PgrQ00175 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PgrQ00175 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PgrQ00175 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PgrQ00175 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PgrQ00175 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PgrQ00175 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PgrQ00175 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PgrQ00175 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PgrQ00175 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PgrQ00175 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PgrQ00175 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PgrQ00175 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PgrQ00175 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PgrQ00175 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PgrQ00175 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PgrQ00175 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PgrQ00175 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PgrQ00175 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PgrQ00175 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PgrQ00175 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PgrQ00175 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PgrQ00175 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PgrQ00175 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PgrQ00175 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PgrQ00175 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PgrQ00175 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PgrQ00175 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PgrQ00175 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PgrQ00175 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PgrQ00175 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PgrQ00175 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PgrQ00175 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PgrQ00175 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PgrQ00175 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PgrQ00175 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PgrQ00175 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PgrQ00175 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PgrQ00175 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PgrQ00175 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PgrQ00175 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PgrQ00175 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PgrQ00175 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PgrQ00175 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PgrQ00175 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PgrQ00175 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PgrQ00175 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PgrQ00175 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PgrQ00175 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PgrQ00175 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PgrQ00175 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PgrQ00175 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PgrQ00175 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PgrQ00175 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PgrQ00175 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PgrQ00175 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PgrQ00175 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PgrQ00175 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PgrQ00175 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PgrQ00175 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PgrQ00175 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PgrQ00175 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PgrQ00175 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PgrQ00175 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PgrQ00175 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PgrQ00175 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PgrQ00175 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PgrQ00175 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PgrQ00175 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PgrQ00175 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PgrQ00175 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PgrQ00175 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PgrQ00175 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PgrQ00175 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PgrQ00175 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PgrQ00175 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PgrQ00175 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PgrQ00175 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PgrQ00175 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PgrQ00175 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PgrQ00175 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PgrQ00175 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PgrQ00175 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PgrQ00175 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PgrQ00175 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PgrQ00175 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PgrQ00175 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PgrQ00175 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PgrQ00175 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PgrQ00175 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PgrQ00175 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PgrQ00175 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PgrQ00175 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PgrQ00175 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PgrQ00175 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PgrQ00175 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PgrQ00175 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PgrQ00175 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.9 ms