Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Psmb4P99026 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Psmb4P99026 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Psmb4P99026 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Psmb4P99026 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Psmb4P99026 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Psmb4P99026 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Psmb4P99026 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Psmb4P99026 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Psmb4P99026 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Psmb4P99026 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Psmb4P99026 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Psmb4P99026 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Psmb4P99026 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Psmb4P99026 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Psmb4P99026 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Psmb4P99026 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Psmb4P99026 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Psmb4P99026 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Psmb4P99026 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Psmb4P99026 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Psmb4P99026 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Psmb4P99026 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psmb4P99026 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psmb4P99026 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psmb4P99026 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psmb4P99026 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psmb4P99026 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Psmb4P99026 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psmb4P99026 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psmb4P99026 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psmb4P99026 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psmb4P99026 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psmb4P99026 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psmb4P99026 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psmb4P99026 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Psmb4P99026 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Psmb4P99026 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Psmb4P99026 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Psmb4P99026 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psmb4P99026 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psmb4P99026 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Psmb4P99026 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psmb4P99026 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psmb4P99026 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psmb4P99026 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psmb4P99026 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psmb4P99026 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psmb4P99026 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psmb4P99026 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psmb4P99026 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psmb4P99026 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Psmb4P99026 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Psmb4P99026 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Psmb4P99026 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Psmb4P99026 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Psmb4P99026 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Psmb4P99026 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Psmb4P99026 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Psmb4P99026 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Psmb4P99026 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Psmb4P99026 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Psmb4P99026 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Psmb4P99026 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psmb4P99026 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psmb4P99026 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psmb4P99026 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psmb4P99026 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Psmb4P99026 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Psmb4P99026 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Psmb4P99026 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Psmb4P99026 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Psmb4P99026 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Psmb4P99026 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Psmb4P99026 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Psmb4P99026 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Psmb4P99026 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Psmb4P99026 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Psmb4P99026 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psmb4P99026 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psmb4P99026 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psmb4P99026 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psmb4P99026 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psmb4P99026 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Psmb4P99026 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Psmb4P99026 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Psmb4P99026 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Psmb4P99026 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Psmb4P99026 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Psmb4P99026 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Psmb4P99026 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Psmb4P99026 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Psmb4P99026 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Psmb4P99026 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Psmb4P99026 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Psmb4P99026 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Psmb4P99026 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Psmb4P99026 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Psmb4P99026 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Psmb4P99026 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms