Protein–RNA interactions for Protein: P97927

Lama4, Laminin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama4P97927 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lama4P97927 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lama4P97927 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Lama4P97927 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lama4P97927 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lama4P97927 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lama4P97927 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lama4P97927 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lama4P97927 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Lama4P97927 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Lama4P97927 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Lama4P97927 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lama4P97927 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lama4P97927 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lama4P97927 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lama4P97927 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lama4P97927 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lama4P97927 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lama4P97927 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lama4P97927 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lama4P97927 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lama4P97927 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Lama4P97927 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lama4P97927 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lama4P97927 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lama4P97927 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lama4P97927 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lama4P97927 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lama4P97927 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lama4P97927 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lama4P97927 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lama4P97927 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lama4P97927 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lama4P97927 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lama4P97927 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Lama4P97927 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lama4P97927 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lama4P97927 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lama4P97927 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lama4P97927 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lama4P97927 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lama4P97927 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lama4P97927 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lama4P97927 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lama4P97927 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lama4P97927 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lama4P97927 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lama4P97927 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lama4P97927 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Lama4P97927 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lama4P97927 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lama4P97927 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lama4P97927 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lama4P97927 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Lama4P97927 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lama4P97927 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lama4P97927 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Lama4P97927 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lama4P97927 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Lama4P97927 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Lama4P97927 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lama4P97927 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lama4P97927 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lama4P97927 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lama4P97927 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lama4P97927 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lama4P97927 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lama4P97927 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lama4P97927 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lama4P97927 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lama4P97927 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lama4P97927 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lama4P97927 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lama4P97927 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Lama4P97927 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Lama4P97927 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Lama4P97927 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Lama4P97927 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Lama4P97927 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lama4P97927 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lama4P97927 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lama4P97927 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lama4P97927 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lama4P97927 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Lama4P97927 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lama4P97927 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lama4P97927 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lama4P97927 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lama4P97927 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lama4P97927 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lama4P97927 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lama4P97927 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Lama4P97927 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lama4P97927 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Lama4P97927 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lama4P97927 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lama4P97927 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lama4P97927 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lama4P97927 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lama4P97927 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms