Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cry1P97784 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cry1P97784 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cry1P97784 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Cry1P97784 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cry1P97784 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cry1P97784 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cry1P97784 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cry1P97784 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cry1P97784 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cry1P97784 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cry1P97784 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cry1P97784 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cry1P97784 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cry1P97784 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cry1P97784 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cry1P97784 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cry1P97784 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cry1P97784 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cry1P97784 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cry1P97784 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cry1P97784 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cry1P97784 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cry1P97784 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cry1P97784 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cry1P97784 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cry1P97784 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cry1P97784 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cry1P97784 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cry1P97784 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cry1P97784 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cry1P97784 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cry1P97784 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cry1P97784 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cry1P97784 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cry1P97784 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cry1P97784 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cry1P97784 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Cry1P97784 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cry1P97784 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Cry1P97784 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cry1P97784 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cry1P97784 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cry1P97784 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cry1P97784 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cry1P97784 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cry1P97784 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cry1P97784 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cry1P97784 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cry1P97784 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cry1P97784 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cry1P97784 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cry1P97784 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cry1P97784 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cry1P97784 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Cry1P97784 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cry1P97784 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cry1P97784 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cry1P97784 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cry1P97784 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cry1P97784 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cry1P97784 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cry1P97784 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cry1P97784 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cry1P97784 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cry1P97784 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cry1P97784 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cry1P97784 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cry1P97784 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cry1P97784 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Cry1P97784 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Cry1P97784 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Cry1P97784 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Cry1P97784 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cry1P97784 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cry1P97784 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cry1P97784 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cry1P97784 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cry1P97784 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cry1P97784 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cry1P97784 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cry1P97784 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cry1P97784 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cry1P97784 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cry1P97784 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cry1P97784 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Cry1P97784 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cry1P97784 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cry1P97784 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cry1P97784 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cry1P97784 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cry1P97784 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cry1P97784 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cry1P97784 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cry1P97784 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cry1P97784 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cry1P97784 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cry1P97784 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cry1P97784 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Cry1P97784 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms