Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Smarcc1P97496 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Smarcc1P97496 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Smarcc1P97496 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Smarcc1P97496 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Smarcc1P97496 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Smarcc1P97496 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Smarcc1P97496 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Smarcc1P97496 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Smarcc1P97496 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Smarcc1P97496 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Smarcc1P97496 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Smarcc1P97496 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Smarcc1P97496 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Smarcc1P97496 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Smarcc1P97496 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Smarcc1P97496 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Smarcc1P97496 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Smarcc1P97496 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Smarcc1P97496 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Smarcc1P97496 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Smarcc1P97496 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Smarcc1P97496 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Smarcc1P97496 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Smarcc1P97496 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Smarcc1P97496 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Smarcc1P97496 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Smarcc1P97496 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Smarcc1P97496 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Smarcc1P97496 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Smarcc1P97496 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Smarcc1P97496 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Smarcc1P97496 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Smarcc1P97496 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Smarcc1P97496 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Smarcc1P97496 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Smarcc1P97496 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Smarcc1P97496 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Smarcc1P97496 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Smarcc1P97496 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Smarcc1P97496 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Smarcc1P97496 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Smarcc1P97496 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Smarcc1P97496 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Smarcc1P97496 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Smarcc1P97496 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Smarcc1P97496 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Smarcc1P97496 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Smarcc1P97496 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Smarcc1P97496 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Smarcc1P97496 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Smarcc1P97496 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Smarcc1P97496 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Smarcc1P97496 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Smarcc1P97496 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Smarcc1P97496 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Smarcc1P97496 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Smarcc1P97496 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Smarcc1P97496 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Smarcc1P97496 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Smarcc1P97496 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Smarcc1P97496 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Smarcc1P97496 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Smarcc1P97496 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Smarcc1P97496 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Smarcc1P97496 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Smarcc1P97496 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Smarcc1P97496 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Smarcc1P97496 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Smarcc1P97496 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Smarcc1P97496 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Smarcc1P97496 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Smarcc1P97496 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Smarcc1P97496 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Smarcc1P97496 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Smarcc1P97496 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Smarcc1P97496 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Smarcc1P97496 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Smarcc1P97496 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Smarcc1P97496 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Smarcc1P97496 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Smarcc1P97496 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Smarcc1P97496 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Smarcc1P97496 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Smarcc1P97496 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Smarcc1P97496 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Smarcc1P97496 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Smarcc1P97496 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Smarcc1P97496 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Smarcc1P97496 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Smarcc1P97496 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Smarcc1P97496 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Smarcc1P97496 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Smarcc1P97496 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Smarcc1P97496 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Smarcc1P97496 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Smarcc1P97496 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Smarcc1P97496 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Smarcc1P97496 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Smarcc1P97496 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms