Protein–RNA interactions for Protein: P97459

Npas1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas1P97459 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Npas1P97459 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Npas1P97459 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Npas1P97459 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Npas1P97459 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Npas1P97459 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Npas1P97459 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Npas1P97459 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Npas1P97459 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Npas1P97459 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Npas1P97459 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Npas1P97459 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Npas1P97459 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Npas1P97459 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Npas1P97459 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Npas1P97459 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Npas1P97459 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Npas1P97459 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Npas1P97459 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Npas1P97459 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Npas1P97459 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Npas1P97459 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Npas1P97459 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Npas1P97459 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Npas1P97459 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Npas1P97459 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Npas1P97459 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Npas1P97459 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Npas1P97459 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Npas1P97459 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Npas1P97459 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Npas1P97459 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Npas1P97459 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Npas1P97459 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Npas1P97459 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Npas1P97459 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Npas1P97459 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Npas1P97459 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Npas1P97459 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Npas1P97459 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Npas1P97459 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Npas1P97459 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Npas1P97459 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Npas1P97459 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Npas1P97459 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Npas1P97459 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Npas1P97459 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Npas1P97459 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Npas1P97459 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Npas1P97459 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Npas1P97459 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Npas1P97459 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Npas1P97459 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Npas1P97459 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Npas1P97459 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Npas1P97459 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Npas1P97459 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Npas1P97459 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Npas1P97459 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Npas1P97459 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Npas1P97459 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Npas1P97459 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Npas1P97459 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Npas1P97459 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Npas1P97459 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Npas1P97459 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Npas1P97459 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Npas1P97459 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Npas1P97459 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Npas1P97459 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Npas1P97459 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Npas1P97459 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Npas1P97459 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Npas1P97459 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Npas1P97459 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Npas1P97459 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Npas1P97459 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Npas1P97459 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Npas1P97459 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Npas1P97459 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Npas1P97459 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Npas1P97459 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Npas1P97459 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Npas1P97459 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Npas1P97459 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Npas1P97459 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Npas1P97459 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Npas1P97459 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Npas1P97459 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Npas1P97459 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Npas1P97459 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Npas1P97459 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Npas1P97459 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Npas1P97459 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Npas1P97459 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Npas1P97459 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Npas1P97459 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Npas1P97459 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Npas1P97459 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Npas1P97459 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms