Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mesp1P97309 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mesp1P97309 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mesp1P97309 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mesp1P97309 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mesp1P97309 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mesp1P97309 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mesp1P97309 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mesp1P97309 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mesp1P97309 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mesp1P97309 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mesp1P97309 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mesp1P97309 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mesp1P97309 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mesp1P97309 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mesp1P97309 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mesp1P97309 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mesp1P97309 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mesp1P97309 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mesp1P97309 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mesp1P97309 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mesp1P97309 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Mesp1P97309 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mesp1P97309 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mesp1P97309 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Mesp1P97309 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mesp1P97309 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Mesp1P97309 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mesp1P97309 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mesp1P97309 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Mesp1P97309 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mesp1P97309 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mesp1P97309 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mesp1P97309 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mesp1P97309 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mesp1P97309 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mesp1P97309 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mesp1P97309 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Mesp1P97309 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mesp1P97309 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Mesp1P97309 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mesp1P97309 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mesp1P97309 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mesp1P97309 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mesp1P97309 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mesp1P97309 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mesp1P97309 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Mesp1P97309 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mesp1P97309 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mesp1P97309 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mesp1P97309 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Mesp1P97309 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mesp1P97309 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mesp1P97309 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mesp1P97309 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mesp1P97309 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mesp1P97309 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mesp1P97309 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mesp1P97309 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mesp1P97309 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mesp1P97309 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Mesp1P97309 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mesp1P97309 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mesp1P97309 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mesp1P97309 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mesp1P97309 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mesp1P97309 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Mesp1P97309 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mesp1P97309 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Mesp1P97309 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Mesp1P97309 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mesp1P97309 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mesp1P97309 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Mesp1P97309 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mesp1P97309 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mesp1P97309 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mesp1P97309 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mesp1P97309 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mesp1P97309 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mesp1P97309 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mesp1P97309 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mesp1P97309 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Mesp1P97309 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mesp1P97309 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mesp1P97309 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mesp1P97309 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mesp1P97309 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mesp1P97309 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mesp1P97309 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mesp1P97309 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Mesp1P97309 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mesp1P97309 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mesp1P97309 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mesp1P97309 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mesp1P97309 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mesp1P97309 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mesp1P97309 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Mesp1P97309 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mesp1P97309 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mesp1P97309 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms