Protein–RNA interactions for Protein: P86448

Trim43b, Tripartite motif-containing protein 43B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43bP86448 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim43bP86448 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim43bP86448 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim43bP86448 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim43bP86448 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim43bP86448 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim43bP86448 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim43bP86448 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim43bP86448 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim43bP86448 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim43bP86448 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim43bP86448 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim43bP86448 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim43bP86448 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim43bP86448 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim43bP86448 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim43bP86448 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim43bP86448 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim43bP86448 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim43bP86448 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim43bP86448 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim43bP86448 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim43bP86448 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim43bP86448 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim43bP86448 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim43bP86448 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim43bP86448 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim43bP86448 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim43bP86448 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim43bP86448 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim43bP86448 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim43bP86448 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim43bP86448 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim43bP86448 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim43bP86448 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim43bP86448 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim43bP86448 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim43bP86448 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim43bP86448 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim43bP86448 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim43bP86448 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim43bP86448 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim43bP86448 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim43bP86448 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim43bP86448 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim43bP86448 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim43bP86448 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim43bP86448 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim43bP86448 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim43bP86448 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim43bP86448 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim43bP86448 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim43bP86448 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim43bP86448 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim43bP86448 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim43bP86448 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim43bP86448 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trim43bP86448 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Trim43bP86448 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Trim43bP86448 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Trim43bP86448 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Trim43bP86448 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Trim43bP86448 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim43bP86448 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Trim43bP86448 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Trim43bP86448 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim43bP86448 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim43bP86448 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim43bP86448 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim43bP86448 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim43bP86448 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim43bP86448 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim43bP86448 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim43bP86448 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim43bP86448 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim43bP86448 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim43bP86448 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim43bP86448 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim43bP86448 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Trim43bP86448 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Trim43bP86448 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim43bP86448 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Trim43bP86448 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim43bP86448 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Trim43bP86448 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim43bP86448 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Trim43bP86448 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Trim43bP86448 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim43bP86448 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim43bP86448 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim43bP86448 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Trim43bP86448 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim43bP86448 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim43bP86448 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim43bP86448 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim43bP86448 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Trim43bP86448 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim43bP86448 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim43bP86448 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Trim43bP86448 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms