Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubg1P83887 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubg1P83887 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubg1P83887 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubg1P83887 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubg1P83887 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubg1P83887 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubg1P83887 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubg1P83887 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubg1P83887 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubg1P83887 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubg1P83887 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubg1P83887 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubg1P83887 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubg1P83887 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubg1P83887 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubg1P83887 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubg1P83887 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubg1P83887 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubg1P83887 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubg1P83887 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubg1P83887 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubg1P83887 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubg1P83887 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubg1P83887 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubg1P83887 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tubg1P83887 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubg1P83887 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubg1P83887 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubg1P83887 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubg1P83887 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubg1P83887 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubg1P83887 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubg1P83887 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubg1P83887 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubg1P83887 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubg1P83887 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubg1P83887 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubg1P83887 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubg1P83887 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubg1P83887 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubg1P83887 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubg1P83887 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubg1P83887 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubg1P83887 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubg1P83887 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubg1P83887 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubg1P83887 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubg1P83887 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubg1P83887 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubg1P83887 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubg1P83887 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubg1P83887 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubg1P83887 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubg1P83887 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubg1P83887 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubg1P83887 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubg1P83887 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubg1P83887 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubg1P83887 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubg1P83887 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubg1P83887 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubg1P83887 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubg1P83887 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubg1P83887 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tubg1P83887 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubg1P83887 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubg1P83887 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubg1P83887 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubg1P83887 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubg1P83887 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubg1P83887 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubg1P83887 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubg1P83887 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubg1P83887 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubg1P83887 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubg1P83887 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubg1P83887 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubg1P83887 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubg1P83887 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubg1P83887 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubg1P83887 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubg1P83887 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubg1P83887 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubg1P83887 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubg1P83887 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubg1P83887 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubg1P83887 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubg1P83887 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubg1P83887 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubg1P83887 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubg1P83887 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubg1P83887 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubg1P83887 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubg1P83887 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubg1P83887 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubg1P83887 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubg1P83887 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubg1P83887 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubg1P83887 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms