Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gbx1P82976 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gbx1P82976 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gbx1P82976 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gbx1P82976 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gbx1P82976 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gbx1P82976 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gbx1P82976 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gbx1P82976 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gbx1P82976 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gbx1P82976 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gbx1P82976 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gbx1P82976 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gbx1P82976 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gbx1P82976 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gbx1P82976 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gbx1P82976 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gbx1P82976 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gbx1P82976 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gbx1P82976 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gbx1P82976 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gbx1P82976 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gbx1P82976 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gbx1P82976 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gbx1P82976 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gbx1P82976 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gbx1P82976 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gbx1P82976 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gbx1P82976 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gbx1P82976 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gbx1P82976 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gbx1P82976 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gbx1P82976 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gbx1P82976 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gbx1P82976 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gbx1P82976 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gbx1P82976 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Gbx1P82976 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gbx1P82976 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gbx1P82976 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gbx1P82976 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gbx1P82976 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gbx1P82976 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gbx1P82976 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Gbx1P82976 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gbx1P82976 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gbx1P82976 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gbx1P82976 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gbx1P82976 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gbx1P82976 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gbx1P82976 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gbx1P82976 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Gbx1P82976 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gbx1P82976 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gbx1P82976 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gbx1P82976 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gbx1P82976 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gbx1P82976 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Gbx1P82976 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gbx1P82976 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gbx1P82976 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gbx1P82976 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gbx1P82976 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gbx1P82976 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gbx1P82976 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gbx1P82976 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gbx1P82976 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gbx1P82976 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gbx1P82976 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gbx1P82976 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gbx1P82976 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gbx1P82976 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gbx1P82976 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gbx1P82976 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gbx1P82976 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gbx1P82976 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gbx1P82976 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gbx1P82976 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gbx1P82976 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gbx1P82976 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gbx1P82976 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Gbx1P82976 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gbx1P82976 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gbx1P82976 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gbx1P82976 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gbx1P82976 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gbx1P82976 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gbx1P82976 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gbx1P82976 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gbx1P82976 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Gbx1P82976 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gbx1P82976 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gbx1P82976 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gbx1P82976 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gbx1P82976 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gbx1P82976 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gbx1P82976 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gbx1P82976 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gbx1P82976 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gbx1P82976 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms