Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gabpb2P81069 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gabpb2P81069 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gabpb2P81069 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Gabpb2P81069 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gabpb2P81069 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gabpb2P81069 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gabpb2P81069 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gabpb2P81069 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gabpb2P81069 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gabpb2P81069 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gabpb2P81069 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gabpb2P81069 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gabpb2P81069 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Gabpb2P81069 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gabpb2P81069 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gabpb2P81069 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gabpb2P81069 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Gabpb2P81069 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gabpb2P81069 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gabpb2P81069 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gabpb2P81069 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gabpb2P81069 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gabpb2P81069 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gabpb2P81069 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gabpb2P81069 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gabpb2P81069 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gabpb2P81069 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gabpb2P81069 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gabpb2P81069 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gabpb2P81069 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gabpb2P81069 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gabpb2P81069 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gabpb2P81069 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gabpb2P81069 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gabpb2P81069 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gabpb2P81069 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gabpb2P81069 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gabpb2P81069 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gabpb2P81069 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gabpb2P81069 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gabpb2P81069 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gabpb2P81069 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gabpb2P81069 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gabpb2P81069 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gabpb2P81069 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gabpb2P81069 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gabpb2P81069 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gabpb2P81069 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gabpb2P81069 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gabpb2P81069 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gabpb2P81069 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gabpb2P81069 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gabpb2P81069 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gabpb2P81069 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gabpb2P81069 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gabpb2P81069 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gabpb2P81069 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gabpb2P81069 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gabpb2P81069 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gabpb2P81069 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gabpb2P81069 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gabpb2P81069 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gabpb2P81069 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gabpb2P81069 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gabpb2P81069 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gabpb2P81069 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gabpb2P81069 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Gabpb2P81069 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gabpb2P81069 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gabpb2P81069 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gabpb2P81069 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gabpb2P81069 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gabpb2P81069 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gabpb2P81069 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gabpb2P81069 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gabpb2P81069 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gabpb2P81069 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gabpb2P81069 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gabpb2P81069 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gabpb2P81069 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gabpb2P81069 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gabpb2P81069 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gabpb2P81069 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gabpb2P81069 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gabpb2P81069 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gabpb2P81069 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gabpb2P81069 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gabpb2P81069 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gabpb2P81069 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gabpb2P81069 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gabpb2P81069 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gabpb2P81069 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gabpb2P81069 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gabpb2P81069 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gabpb2P81069 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gabpb2P81069 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gabpb2P81069 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Gabpb2P81069 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gabpb2P81069 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms