Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irx2P81066 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irx2P81066 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irx2P81066 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irx2P81066 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irx2P81066 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irx2P81066 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irx2P81066 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irx2P81066 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irx2P81066 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irx2P81066 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx2P81066 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx2P81066 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx2P81066 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx2P81066 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx2P81066 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx2P81066 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx2P81066 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx2P81066 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx2P81066 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irx2P81066 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irx2P81066 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irx2P81066 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irx2P81066 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irx2P81066 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irx2P81066 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irx2P81066 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irx2P81066 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Irx2P81066 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irx2P81066 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irx2P81066 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irx2P81066 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irx2P81066 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irx2P81066 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irx2P81066 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Irx2P81066 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Irx2P81066 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Irx2P81066 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Irx2P81066 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Irx2P81066 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Irx2P81066 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Irx2P81066 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Irx2P81066 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irx2P81066 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irx2P81066 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irx2P81066 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irx2P81066 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irx2P81066 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irx2P81066 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irx2P81066 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Irx2P81066 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irx2P81066 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irx2P81066 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irx2P81066 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irx2P81066 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irx2P81066 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irx2P81066 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irx2P81066 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irx2P81066 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irx2P81066 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irx2P81066 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irx2P81066 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irx2P81066 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irx2P81066 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irx2P81066 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irx2P81066 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irx2P81066 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irx2P81066 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irx2P81066 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irx2P81066 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irx2P81066 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irx2P81066 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irx2P81066 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irx2P81066 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irx2P81066 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irx2P81066 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irx2P81066 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irx2P81066 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irx2P81066 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irx2P81066 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irx2P81066 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irx2P81066 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irx2P81066 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irx2P81066 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irx2P81066 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irx2P81066 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irx2P81066 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irx2P81066 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irx2P81066 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irx2P81066 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irx2P81066 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irx2P81066 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irx2P81066 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irx2P81066 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irx2P81066 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irx2P81066 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irx2P81066 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irx2P81066 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irx2P81066 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irx2P81066 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms