Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rad50P70388 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rad50P70388 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Rad50P70388 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rad50P70388 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rad50P70388 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Rad50P70388 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rad50P70388 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rad50P70388 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rad50P70388 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rad50P70388 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rad50P70388 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rad50P70388 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rad50P70388 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rad50P70388 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rad50P70388 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rad50P70388 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rad50P70388 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rad50P70388 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rad50P70388 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rad50P70388 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rad50P70388 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rad50P70388 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rad50P70388 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rad50P70388 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rad50P70388 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rad50P70388 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rad50P70388 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rad50P70388 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rad50P70388 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rad50P70388 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rad50P70388 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rad50P70388 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rad50P70388 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rad50P70388 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rad50P70388 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rad50P70388 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rad50P70388 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rad50P70388 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rad50P70388 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Rad50P70388 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rad50P70388 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rad50P70388 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Rad50P70388 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rad50P70388 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rad50P70388 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Rad50P70388 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rad50P70388 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Rad50P70388 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rad50P70388 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rad50P70388 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rad50P70388 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rad50P70388 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rad50P70388 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Rad50P70388 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rad50P70388 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rad50P70388 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rad50P70388 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rad50P70388 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rad50P70388 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rad50P70388 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rad50P70388 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rad50P70388 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rad50P70388 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rad50P70388 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rad50P70388 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rad50P70388 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rad50P70388 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rad50P70388 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rad50P70388 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rad50P70388 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Rad50P70388 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Rad50P70388 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rad50P70388 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rad50P70388 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rad50P70388 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rad50P70388 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rad50P70388 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rad50P70388 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rad50P70388 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rad50P70388 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Rad50P70388 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rad50P70388 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rad50P70388 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Rad50P70388 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rad50P70388 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rad50P70388 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rad50P70388 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rad50P70388 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rad50P70388 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rad50P70388 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rad50P70388 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rad50P70388 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rad50P70388 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rad50P70388 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rad50P70388 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rad50P70388 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rad50P70388 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rad50P70388 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rad50P70388 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms