Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gfi1P70338 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gfi1P70338 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gfi1P70338 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gfi1P70338 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gfi1P70338 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Gfi1P70338 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gfi1P70338 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gfi1P70338 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gfi1P70338 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gfi1P70338 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gfi1P70338 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gfi1P70338 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gfi1P70338 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gfi1P70338 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gfi1P70338 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gfi1P70338 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gfi1P70338 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gfi1P70338 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gfi1P70338 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gfi1P70338 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gfi1P70338 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gfi1P70338 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gfi1P70338 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gfi1P70338 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gfi1P70338 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gfi1P70338 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gfi1P70338 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gfi1P70338 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gfi1P70338 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gfi1P70338 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gfi1P70338 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gfi1P70338 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Gfi1P70338 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gfi1P70338 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gfi1P70338 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gfi1P70338 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gfi1P70338 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Gfi1P70338 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gfi1P70338 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gfi1P70338 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gfi1P70338 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gfi1P70338 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gfi1P70338 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gfi1P70338 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gfi1P70338 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gfi1P70338 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gfi1P70338 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gfi1P70338 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gfi1P70338 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gfi1P70338 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gfi1P70338 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gfi1P70338 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gfi1P70338 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gfi1P70338 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gfi1P70338 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gfi1P70338 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gfi1P70338 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gfi1P70338 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gfi1P70338 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gfi1P70338 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gfi1P70338 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gfi1P70338 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gfi1P70338 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gfi1P70338 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gfi1P70338 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gfi1P70338 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gfi1P70338 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gfi1P70338 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Gfi1P70338 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gfi1P70338 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gfi1P70338 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gfi1P70338 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gfi1P70338 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Gfi1P70338 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gfi1P70338 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gfi1P70338 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gfi1P70338 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gfi1P70338 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gfi1P70338 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gfi1P70338 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gfi1P70338 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gfi1P70338 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gfi1P70338 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gfi1P70338 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gfi1P70338 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gfi1P70338 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Gfi1P70338 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gfi1P70338 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gfi1P70338 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gfi1P70338 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gfi1P70338 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gfi1P70338 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gfi1P70338 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gfi1P70338 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gfi1P70338 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gfi1P70338 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gfi1P70338 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gfi1P70338 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gfi1P70338 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms