Protein–RNA interactions for Protein: P70278

Stra8, Stimulated by retinoic acid gene 8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra8P70278 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Stra8P70278 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Stra8P70278 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Stra8P70278 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Stra8P70278 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Stra8P70278 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Stra8P70278 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Stra8P70278 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Stra8P70278 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Stra8P70278 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Stra8P70278 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Stra8P70278 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Stra8P70278 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Stra8P70278 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Stra8P70278 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Stra8P70278 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Stra8P70278 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Stra8P70278 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Stra8P70278 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Stra8P70278 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Stra8P70278 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Stra8P70278 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Stra8P70278 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Stra8P70278 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Stra8P70278 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Stra8P70278 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Stra8P70278 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Stra8P70278 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Stra8P70278 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Stra8P70278 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Stra8P70278 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Stra8P70278 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Stra8P70278 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Stra8P70278 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Stra8P70278 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Stra8P70278 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Stra8P70278 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Stra8P70278 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Stra8P70278 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Stra8P70278 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Stra8P70278 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Stra8P70278 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Stra8P70278 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Stra8P70278 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Stra8P70278 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Stra8P70278 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Stra8P70278 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Stra8P70278 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Stra8P70278 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Stra8P70278 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Stra8P70278 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Stra8P70278 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Stra8P70278 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Stra8P70278 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Stra8P70278 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Stra8P70278 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Stra8P70278 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Stra8P70278 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Stra8P70278 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Stra8P70278 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Stra8P70278 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Stra8P70278 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Stra8P70278 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Stra8P70278 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Stra8P70278 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Stra8P70278 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Stra8P70278 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Stra8P70278 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Stra8P70278 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Stra8P70278 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Stra8P70278 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Stra8P70278 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Stra8P70278 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Stra8P70278 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Stra8P70278 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Stra8P70278 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Stra8P70278 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Stra8P70278 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Stra8P70278 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Stra8P70278 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Stra8P70278 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Stra8P70278 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
Stra8P70278 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Stra8P70278 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Stra8P70278 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Stra8P70278 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Stra8P70278 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Stra8P70278 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Stra8P70278 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Stra8P70278 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Stra8P70278 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Stra8P70278 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Stra8P70278 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Stra8P70278 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Stra8P70278 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Stra8P70278 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Stra8P70278 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Stra8P70278 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Stra8P70278 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Stra8P70278 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms