Protein–RNA interactions for Protein: P70195

Psmb7, Proteasome subunit beta type-7, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb7P70195 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmb7P70195 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmb7P70195 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmb7P70195 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmb7P70195 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmb7P70195 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmb7P70195 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmb7P70195 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmb7P70195 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmb7P70195 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmb7P70195 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmb7P70195 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmb7P70195 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psmb7P70195 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psmb7P70195 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psmb7P70195 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psmb7P70195 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Psmb7P70195 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psmb7P70195 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psmb7P70195 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psmb7P70195 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psmb7P70195 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psmb7P70195 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psmb7P70195 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psmb7P70195 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psmb7P70195 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psmb7P70195 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psmb7P70195 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psmb7P70195 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psmb7P70195 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Psmb7P70195 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psmb7P70195 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psmb7P70195 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psmb7P70195 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psmb7P70195 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psmb7P70195 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psmb7P70195 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psmb7P70195 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psmb7P70195 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psmb7P70195 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psmb7P70195 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Psmb7P70195 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psmb7P70195 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psmb7P70195 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psmb7P70195 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Psmb7P70195 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psmb7P70195 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psmb7P70195 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psmb7P70195 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psmb7P70195 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psmb7P70195 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psmb7P70195 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psmb7P70195 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psmb7P70195 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psmb7P70195 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psmb7P70195 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psmb7P70195 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psmb7P70195 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmb7P70195 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmb7P70195 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmb7P70195 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmb7P70195 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmb7P70195 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmb7P70195 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmb7P70195 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmb7P70195 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmb7P70195 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmb7P70195 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmb7P70195 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmb7P70195 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmb7P70195 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmb7P70195 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmb7P70195 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmb7P70195 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmb7P70195 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Psmb7P70195 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Psmb7P70195 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Psmb7P70195 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Psmb7P70195 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Psmb7P70195 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Psmb7P70195 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Psmb7P70195 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Psmb7P70195 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Psmb7P70195 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Psmb7P70195 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Psmb7P70195 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psmb7P70195 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psmb7P70195 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psmb7P70195 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psmb7P70195 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psmb7P70195 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psmb7P70195 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psmb7P70195 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psmb7P70195 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psmb7P70195 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Psmb7P70195 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Psmb7P70195 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Psmb7P70195 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Psmb7P70195 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Psmb7P70195 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms