Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Traf5P70191 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Traf5P70191 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Traf5P70191 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Traf5P70191 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Traf5P70191 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Traf5P70191 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Traf5P70191 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Traf5P70191 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Traf5P70191 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Traf5P70191 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Traf5P70191 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Traf5P70191 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Traf5P70191 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Traf5P70191 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Traf5P70191 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Traf5P70191 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Traf5P70191 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Traf5P70191 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Traf5P70191 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Traf5P70191 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Traf5P70191 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Traf5P70191 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Traf5P70191 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Traf5P70191 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Traf5P70191 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Traf5P70191 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Traf5P70191 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Traf5P70191 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Traf5P70191 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Traf5P70191 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Traf5P70191 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Traf5P70191 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Traf5P70191 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Traf5P70191 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Traf5P70191 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Traf5P70191 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Traf5P70191 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Traf5P70191 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Traf5P70191 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Traf5P70191 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Traf5P70191 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Traf5P70191 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Traf5P70191 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Traf5P70191 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Traf5P70191 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Traf5P70191 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Traf5P70191 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Traf5P70191 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Traf5P70191 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Traf5P70191 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Traf5P70191 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Traf5P70191 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Traf5P70191 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Traf5P70191 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Traf5P70191 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Traf5P70191 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Traf5P70191 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Traf5P70191 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Traf5P70191 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Traf5P70191 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Traf5P70191 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Traf5P70191 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Traf5P70191 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Traf5P70191 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Traf5P70191 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Traf5P70191 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Traf5P70191 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Traf5P70191 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Traf5P70191 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Traf5P70191 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Traf5P70191 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Traf5P70191 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Traf5P70191 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Traf5P70191 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Traf5P70191 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Traf5P70191 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Traf5P70191 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Traf5P70191 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Traf5P70191 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Traf5P70191 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Traf5P70191 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Traf5P70191 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Traf5P70191 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Traf5P70191 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Traf5P70191 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Traf5P70191 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Traf5P70191 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Traf5P70191 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Traf5P70191 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Traf5P70191 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Traf5P70191 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Traf5P70191 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Traf5P70191 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Traf5P70191 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Traf5P70191 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Traf5P70191 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Traf5P70191 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Traf5P70191 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Traf5P70191 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms