Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SbdsP70122 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SbdsP70122 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SbdsP70122 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SbdsP70122 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SbdsP70122 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SbdsP70122 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SbdsP70122 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SbdsP70122 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SbdsP70122 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SbdsP70122 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SbdsP70122 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SbdsP70122 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SbdsP70122 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SbdsP70122 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SbdsP70122 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SbdsP70122 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SbdsP70122 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SbdsP70122 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SbdsP70122 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SbdsP70122 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SbdsP70122 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SbdsP70122 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SbdsP70122 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SbdsP70122 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SbdsP70122 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SbdsP70122 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SbdsP70122 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SbdsP70122 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SbdsP70122 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SbdsP70122 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SbdsP70122 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SbdsP70122 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SbdsP70122 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SbdsP70122 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SbdsP70122 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SbdsP70122 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SbdsP70122 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SbdsP70122 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SbdsP70122 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SbdsP70122 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SbdsP70122 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SbdsP70122 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SbdsP70122 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SbdsP70122 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SbdsP70122 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SbdsP70122 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SbdsP70122 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SbdsP70122 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SbdsP70122 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SbdsP70122 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SbdsP70122 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SbdsP70122 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SbdsP70122 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SbdsP70122 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SbdsP70122 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SbdsP70122 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SbdsP70122 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SbdsP70122 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SbdsP70122 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SbdsP70122 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SbdsP70122 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SbdsP70122 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SbdsP70122 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SbdsP70122 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SbdsP70122 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SbdsP70122 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SbdsP70122 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SbdsP70122 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SbdsP70122 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SbdsP70122 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SbdsP70122 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SbdsP70122 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SbdsP70122 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SbdsP70122 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SbdsP70122 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SbdsP70122 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SbdsP70122 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SbdsP70122 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SbdsP70122 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SbdsP70122 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SbdsP70122 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SbdsP70122 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SbdsP70122 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SbdsP70122 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SbdsP70122 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SbdsP70122 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SbdsP70122 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SbdsP70122 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SbdsP70122 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SbdsP70122 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SbdsP70122 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SbdsP70122 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SbdsP70122 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SbdsP70122 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SbdsP70122 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SbdsP70122 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SbdsP70122 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SbdsP70122 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SbdsP70122 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms