Protein–RNA interactions for Protein: P63158

Hmgb1, High mobility group protein B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgb1P63158 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hmgb1P63158 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hmgb1P63158 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hmgb1P63158 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hmgb1P63158 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hmgb1P63158 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hmgb1P63158 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hmgb1P63158 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hmgb1P63158 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hmgb1P63158 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hmgb1P63158 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hmgb1P63158 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hmgb1P63158 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hmgb1P63158 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hmgb1P63158 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Hmgb1P63158 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Hmgb1P63158 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hmgb1P63158 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hmgb1P63158 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hmgb1P63158 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Hmgb1P63158 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hmgb1P63158 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hmgb1P63158 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hmgb1P63158 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hmgb1P63158 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hmgb1P63158 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hmgb1P63158 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hmgb1P63158 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hmgb1P63158 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hmgb1P63158 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hmgb1P63158 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hmgb1P63158 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hmgb1P63158 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hmgb1P63158 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hmgb1P63158 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hmgb1P63158 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hmgb1P63158 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hmgb1P63158 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hmgb1P63158 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Hmgb1P63158 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hmgb1P63158 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Hmgb1P63158 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Hmgb1P63158 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hmgb1P63158 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hmgb1P63158 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hmgb1P63158 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hmgb1P63158 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hmgb1P63158 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hmgb1P63158 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Hmgb1P63158 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hmgb1P63158 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hmgb1P63158 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hmgb1P63158 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hmgb1P63158 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hmgb1P63158 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hmgb1P63158 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Hmgb1P63158 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hmgb1P63158 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hmgb1P63158 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hmgb1P63158 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hmgb1P63158 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hmgb1P63158 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hmgb1P63158 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hmgb1P63158 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hmgb1P63158 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hmgb1P63158 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hmgb1P63158 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hmgb1P63158 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hmgb1P63158 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hmgb1P63158 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hmgb1P63158 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hmgb1P63158 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hmgb1P63158 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hmgb1P63158 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hmgb1P63158 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hmgb1P63158 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hmgb1P63158 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hmgb1P63158 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hmgb1P63158 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hmgb1P63158 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hmgb1P63158 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hmgb1P63158 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hmgb1P63158 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hmgb1P63158 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hmgb1P63158 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hmgb1P63158 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hmgb1P63158 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hmgb1P63158 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hmgb1P63158 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hmgb1P63158 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hmgb1P63158 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hmgb1P63158 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hmgb1P63158 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hmgb1P63158 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hmgb1P63158 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hmgb1P63158 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hmgb1P63158 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hmgb1P63158 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hmgb1P63158 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hmgb1P63158 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms