Protein–RNA interactions for Protein: P62984

Uba52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba52P62984 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Uba52P62984 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Uba52P62984 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Uba52P62984 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Uba52P62984 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Uba52P62984 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Uba52P62984 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Uba52P62984 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Uba52P62984 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Uba52P62984 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Uba52P62984 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Uba52P62984 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Uba52P62984 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Uba52P62984 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Uba52P62984 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Uba52P62984 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Uba52P62984 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Uba52P62984 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Uba52P62984 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Uba52P62984 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Uba52P62984 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Uba52P62984 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Uba52P62984 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Uba52P62984 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Uba52P62984 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Uba52P62984 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Uba52P62984 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Uba52P62984 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Uba52P62984 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Uba52P62984 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Uba52P62984 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Uba52P62984 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Uba52P62984 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Uba52P62984 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Uba52P62984 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Uba52P62984 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Uba52P62984 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Uba52P62984 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Uba52P62984 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Uba52P62984 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Uba52P62984 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Uba52P62984 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Uba52P62984 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Uba52P62984 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Uba52P62984 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Uba52P62984 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Uba52P62984 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Uba52P62984 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Uba52P62984 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Uba52P62984 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Uba52P62984 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Uba52P62984 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Uba52P62984 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Uba52P62984 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Uba52P62984 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Uba52P62984 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Uba52P62984 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Uba52P62984 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Uba52P62984 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Uba52P62984 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Uba52P62984 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Uba52P62984 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Uba52P62984 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Uba52P62984 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Uba52P62984 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Uba52P62984 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Uba52P62984 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Uba52P62984 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Uba52P62984 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Uba52P62984 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Uba52P62984 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Uba52P62984 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Uba52P62984 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Uba52P62984 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Uba52P62984 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Uba52P62984 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Uba52P62984 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Uba52P62984 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Uba52P62984 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Uba52P62984 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Uba52P62984 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Uba52P62984 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Uba52P62984 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Uba52P62984 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Uba52P62984 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Uba52P62984 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Uba52P62984 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Uba52P62984 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Uba52P62984 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Uba52P62984 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Uba52P62984 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Uba52P62984 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Uba52P62984 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Uba52P62984 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Uba52P62984 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Uba52P62984 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Uba52P62984 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Uba52P62984 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Uba52P62984 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Uba52P62984 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms