Protein–RNA interactions for Protein: P62983

Rps27a, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27aP62983 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps27aP62983 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps27aP62983 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps27aP62983 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps27aP62983 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps27aP62983 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps27aP62983 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps27aP62983 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps27aP62983 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps27aP62983 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps27aP62983 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps27aP62983 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps27aP62983 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps27aP62983 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps27aP62983 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps27aP62983 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps27aP62983 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps27aP62983 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps27aP62983 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps27aP62983 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps27aP62983 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps27aP62983 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps27aP62983 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps27aP62983 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps27aP62983 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps27aP62983 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps27aP62983 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps27aP62983 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps27aP62983 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps27aP62983 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps27aP62983 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps27aP62983 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps27aP62983 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps27aP62983 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps27aP62983 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps27aP62983 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps27aP62983 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps27aP62983 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps27aP62983 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps27aP62983 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rps27aP62983 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rps27aP62983 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rps27aP62983 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps27aP62983 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps27aP62983 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps27aP62983 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps27aP62983 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps27aP62983 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps27aP62983 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps27aP62983 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps27aP62983 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps27aP62983 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps27aP62983 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps27aP62983 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps27aP62983 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps27aP62983 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps27aP62983 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps27aP62983 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps27aP62983 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps27aP62983 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps27aP62983 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps27aP62983 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rps27aP62983 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps27aP62983 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps27aP62983 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps27aP62983 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps27aP62983 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps27aP62983 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps27aP62983 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps27aP62983 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps27aP62983 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps27aP62983 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps27aP62983 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps27aP62983 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps27aP62983 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rps27aP62983 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps27aP62983 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps27aP62983 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps27aP62983 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps27aP62983 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps27aP62983 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps27aP62983 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps27aP62983 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps27aP62983 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps27aP62983 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rps27aP62983 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps27aP62983 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps27aP62983 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps27aP62983 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps27aP62983 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps27aP62983 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps27aP62983 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps27aP62983 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps27aP62983 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps27aP62983 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps27aP62983 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps27aP62983 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rps27aP62983 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps27aP62983 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rps27aP62983 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms