Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rps3P62908 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rps3P62908 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rps3P62908 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rps3P62908 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rps3P62908 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Rps3P62908 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Rps3P62908 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rps3P62908 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rps3P62908 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rps3P62908 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rps3P62908 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Rps3P62908 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rps3P62908 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rps3P62908 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rps3P62908 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rps3P62908 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rps3P62908 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rps3P62908 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rps3P62908 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rps3P62908 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rps3P62908 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rps3P62908 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Rps3P62908 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rps3P62908 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rps3P62908 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rps3P62908 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rps3P62908 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rps3P62908 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rps3P62908 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Rps3P62908 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rps3P62908 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rps3P62908 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rps3P62908 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rps3P62908 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rps3P62908 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rps3P62908 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rps3P62908 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rps3P62908 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rps3P62908 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rps3P62908 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rps3P62908 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rps3P62908 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rps3P62908 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rps3P62908 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rps3P62908 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rps3P62908 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rps3P62908 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rps3P62908 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rps3P62908 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Rps3P62908 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rps3P62908 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rps3P62908 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rps3P62908 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rps3P62908 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rps3P62908 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rps3P62908 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rps3P62908 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Rps3P62908 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rps3P62908 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rps3P62908 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rps3P62908 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rps3P62908 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rps3P62908 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rps3P62908 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rps3P62908 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Rps3P62908 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rps3P62908 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rps3P62908 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rps3P62908 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rps3P62908 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rps3P62908 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rps3P62908 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Rps3P62908 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rps3P62908 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rps3P62908 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rps3P62908 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rps3P62908 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rps3P62908 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rps3P62908 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rps3P62908 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rps3P62908 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rps3P62908 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rps3P62908 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rps3P62908 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rps3P62908 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Rps3P62908 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rps3P62908 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rps3P62908 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rps3P62908 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rps3P62908 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rps3P62908 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rps3P62908 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rps3P62908 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Rps3P62908 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rps3P62908 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rps3P62908 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rps3P62908 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rps3P62908 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Rps3P62908 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.8 ms