Protein–RNA interactions for Protein: P62874

Gnb1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnb1P62874 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gnb1P62874 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gnb1P62874 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gnb1P62874 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gnb1P62874 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gnb1P62874 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gnb1P62874 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gnb1P62874 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gnb1P62874 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gnb1P62874 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gnb1P62874 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gnb1P62874 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gnb1P62874 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gnb1P62874 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gnb1P62874 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gnb1P62874 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gnb1P62874 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gnb1P62874 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gnb1P62874 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gnb1P62874 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gnb1P62874 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gnb1P62874 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gnb1P62874 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gnb1P62874 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gnb1P62874 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gnb1P62874 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gnb1P62874 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gnb1P62874 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gnb1P62874 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gnb1P62874 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gnb1P62874 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gnb1P62874 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gnb1P62874 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gnb1P62874 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gnb1P62874 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gnb1P62874 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gnb1P62874 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gnb1P62874 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gnb1P62874 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gnb1P62874 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gnb1P62874 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gnb1P62874 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gnb1P62874 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gnb1P62874 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gnb1P62874 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gnb1P62874 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gnb1P62874 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gnb1P62874 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gnb1P62874 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gnb1P62874 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gnb1P62874 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gnb1P62874 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gnb1P62874 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gnb1P62874 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gnb1P62874 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gnb1P62874 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gnb1P62874 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gnb1P62874 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gnb1P62874 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gnb1P62874 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gnb1P62874 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gnb1P62874 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gnb1P62874 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gnb1P62874 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gnb1P62874 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gnb1P62874 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gnb1P62874 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gnb1P62874 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gnb1P62874 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gnb1P62874 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gnb1P62874 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gnb1P62874 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gnb1P62874 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gnb1P62874 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gnb1P62874 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gnb1P62874 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gnb1P62874 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gnb1P62874 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gnb1P62874 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gnb1P62874 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gnb1P62874 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gnb1P62874 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gnb1P62874 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gnb1P62874 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gnb1P62874 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gnb1P62874 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gnb1P62874 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gnb1P62874 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gnb1P62874 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gnb1P62874 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gnb1P62874 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gnb1P62874 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gnb1P62874 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gnb1P62874 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gnb1P62874 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gnb1P62874 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gnb1P62874 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gnb1P62874 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gnb1P62874 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gnb1P62874 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms