Protein–RNA interactions for Protein: P62869

Elob, Elongin-B, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElobP62869 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ElobP62869 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ElobP62869 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ElobP62869 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ElobP62869 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ElobP62869 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ElobP62869 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ElobP62869 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ElobP62869 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ElobP62869 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ElobP62869 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ElobP62869 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ElobP62869 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ElobP62869 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ElobP62869 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ElobP62869 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ElobP62869 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ElobP62869 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ElobP62869 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ElobP62869 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ElobP62869 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ElobP62869 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ElobP62869 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ElobP62869 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ElobP62869 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ElobP62869 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ElobP62869 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ElobP62869 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ElobP62869 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ElobP62869 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ElobP62869 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ElobP62869 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ElobP62869 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ElobP62869 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ElobP62869 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ElobP62869 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ElobP62869 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ElobP62869 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ElobP62869 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ElobP62869 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ElobP62869 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ElobP62869 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ElobP62869 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ElobP62869 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ElobP62869 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ElobP62869 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ElobP62869 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ElobP62869 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ElobP62869 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ElobP62869 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ElobP62869 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ElobP62869 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ElobP62869 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ElobP62869 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ElobP62869 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ElobP62869 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ElobP62869 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ElobP62869 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ElobP62869 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ElobP62869 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ElobP62869 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ElobP62869 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ElobP62869 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ElobP62869 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ElobP62869 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ElobP62869 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ElobP62869 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ElobP62869 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ElobP62869 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ElobP62869 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ElobP62869 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ElobP62869 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ElobP62869 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ElobP62869 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ElobP62869 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ElobP62869 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ElobP62869 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ElobP62869 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ElobP62869 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ElobP62869 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ElobP62869 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ElobP62869 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ElobP62869 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ElobP62869 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ElobP62869 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ElobP62869 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ElobP62869 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ElobP62869 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ElobP62869 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ElobP62869 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ElobP62869 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ElobP62869 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ElobP62869 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ElobP62869 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ElobP62869 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ElobP62869 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ElobP62869 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ElobP62869 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ElobP62869 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ElobP62869 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms