Protein–RNA interactions for Protein: P62830

Rpl23, 60S ribosomal protein L23, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23P62830 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl23P62830 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl23P62830 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl23P62830 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl23P62830 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl23P62830 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl23P62830 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl23P62830 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl23P62830 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl23P62830 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl23P62830 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl23P62830 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl23P62830 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl23P62830 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl23P62830 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl23P62830 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl23P62830 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl23P62830 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl23P62830 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl23P62830 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl23P62830 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl23P62830 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl23P62830 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl23P62830 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl23P62830 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl23P62830 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl23P62830 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl23P62830 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl23P62830 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl23P62830 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl23P62830 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl23P62830 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl23P62830 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl23P62830 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl23P62830 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl23P62830 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl23P62830 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl23P62830 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl23P62830 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl23P62830 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl23P62830 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl23P62830 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl23P62830 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl23P62830 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl23P62830 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl23P62830 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl23P62830 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl23P62830 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl23P62830 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl23P62830 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl23P62830 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl23P62830 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl23P62830 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl23P62830 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl23P62830 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl23P62830 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl23P62830 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl23P62830 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl23P62830 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl23P62830 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl23P62830 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl23P62830 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl23P62830 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl23P62830 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl23P62830 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl23P62830 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl23P62830 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl23P62830 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl23P62830 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl23P62830 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl23P62830 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl23P62830 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl23P62830 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl23P62830 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl23P62830 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl23P62830 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl23P62830 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl23P62830 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl23P62830 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl23P62830 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl23P62830 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl23P62830 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl23P62830 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl23P62830 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl23P62830 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl23P62830 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl23P62830 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl23P62830 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl23P62830 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl23P62830 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl23P62830 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl23P62830 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl23P62830 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl23P62830 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl23P62830 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rpl23P62830 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rpl23P62830 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl23P62830 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl23P62830 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl23P62830 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms