Protein–RNA interactions for Protein: P62334

Psmc6, 26S proteasome regulatory subunit 10B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc6P62334 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Psmc6P62334 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Psmc6P62334 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Psmc6P62334 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Psmc6P62334 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Psmc6P62334 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Psmc6P62334 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Psmc6P62334 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Psmc6P62334 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Psmc6P62334 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Psmc6P62334 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Psmc6P62334 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Psmc6P62334 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Psmc6P62334 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Psmc6P62334 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psmc6P62334 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psmc6P62334 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psmc6P62334 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psmc6P62334 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psmc6P62334 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psmc6P62334 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Psmc6P62334 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psmc6P62334 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psmc6P62334 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psmc6P62334 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psmc6P62334 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psmc6P62334 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psmc6P62334 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psmc6P62334 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psmc6P62334 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psmc6P62334 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psmc6P62334 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psmc6P62334 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Psmc6P62334 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psmc6P62334 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psmc6P62334 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psmc6P62334 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psmc6P62334 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psmc6P62334 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psmc6P62334 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psmc6P62334 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psmc6P62334 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psmc6P62334 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Psmc6P62334 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psmc6P62334 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psmc6P62334 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psmc6P62334 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Psmc6P62334 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psmc6P62334 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psmc6P62334 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psmc6P62334 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psmc6P62334 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psmc6P62334 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psmc6P62334 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psmc6P62334 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psmc6P62334 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psmc6P62334 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psmc6P62334 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Psmc6P62334 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psmc6P62334 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Psmc6P62334 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Psmc6P62334 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Psmc6P62334 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Psmc6P62334 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Psmc6P62334 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Psmc6P62334 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Psmc6P62334 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Psmc6P62334 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Psmc6P62334 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Psmc6P62334 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Psmc6P62334 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Psmc6P62334 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psmc6P62334 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psmc6P62334 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psmc6P62334 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Psmc6P62334 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psmc6P62334 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psmc6P62334 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psmc6P62334 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Psmc6P62334 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Psmc6P62334 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psmc6P62334 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psmc6P62334 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psmc6P62334 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psmc6P62334 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psmc6P62334 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psmc6P62334 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psmc6P62334 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psmc6P62334 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psmc6P62334 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psmc6P62334 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psmc6P62334 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psmc6P62334 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Psmc6P62334 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psmc6P62334 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psmc6P62334 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psmc6P62334 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psmc6P62334 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Psmc6P62334 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psmc6P62334 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms