Protein–RNA interactions for Protein: P62305

Snrpe, Small nuclear ribonucleoprotein E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpeP62305 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SnrpeP62305 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpeP62305 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpeP62305 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpeP62305 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpeP62305 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpeP62305 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpeP62305 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpeP62305 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpeP62305 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpeP62305 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpeP62305 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpeP62305 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpeP62305 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpeP62305 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpeP62305 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpeP62305 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpeP62305 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpeP62305 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpeP62305 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpeP62305 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpeP62305 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpeP62305 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpeP62305 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpeP62305 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpeP62305 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpeP62305 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpeP62305 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpeP62305 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpeP62305 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpeP62305 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpeP62305 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpeP62305 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpeP62305 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpeP62305 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpeP62305 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpeP62305 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpeP62305 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpeP62305 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpeP62305 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpeP62305 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpeP62305 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpeP62305 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpeP62305 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpeP62305 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpeP62305 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpeP62305 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpeP62305 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpeP62305 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpeP62305 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpeP62305 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpeP62305 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpeP62305 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpeP62305 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpeP62305 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpeP62305 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpeP62305 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpeP62305 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpeP62305 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpeP62305 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpeP62305 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpeP62305 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpeP62305 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpeP62305 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpeP62305 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpeP62305 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpeP62305 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpeP62305 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpeP62305 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpeP62305 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpeP62305 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpeP62305 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpeP62305 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpeP62305 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpeP62305 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpeP62305 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpeP62305 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpeP62305 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpeP62305 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpeP62305 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpeP62305 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpeP62305 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpeP62305 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpeP62305 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpeP62305 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpeP62305 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpeP62305 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpeP62305 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpeP62305 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpeP62305 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpeP62305 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpeP62305 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpeP62305 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpeP62305 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpeP62305 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpeP62305 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpeP62305 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpeP62305 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpeP62305 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpeP62305 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms