Protein–RNA interactions for Protein: P61375

Lhx5, LIM/homeobox protein Lhx5, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx5P61375 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lhx5P61375 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lhx5P61375 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Lhx5P61375 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lhx5P61375 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lhx5P61375 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lhx5P61375 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lhx5P61375 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lhx5P61375 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lhx5P61375 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lhx5P61375 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lhx5P61375 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lhx5P61375 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lhx5P61375 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lhx5P61375 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lhx5P61375 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Lhx5P61375 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lhx5P61375 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lhx5P61375 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lhx5P61375 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lhx5P61375 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lhx5P61375 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lhx5P61375 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lhx5P61375 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lhx5P61375 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lhx5P61375 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Lhx5P61375 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lhx5P61375 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lhx5P61375 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lhx5P61375 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lhx5P61375 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lhx5P61375 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lhx5P61375 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lhx5P61375 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lhx5P61375 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lhx5P61375 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Lhx5P61375 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lhx5P61375 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lhx5P61375 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lhx5P61375 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lhx5P61375 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lhx5P61375 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lhx5P61375 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Lhx5P61375 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lhx5P61375 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lhx5P61375 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lhx5P61375 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lhx5P61375 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lhx5P61375 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lhx5P61375 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lhx5P61375 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lhx5P61375 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lhx5P61375 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lhx5P61375 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lhx5P61375 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Lhx5P61375 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lhx5P61375 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lhx5P61375 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lhx5P61375 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lhx5P61375 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lhx5P61375 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lhx5P61375 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lhx5P61375 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Lhx5P61375 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Lhx5P61375 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Lhx5P61375 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lhx5P61375 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lhx5P61375 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lhx5P61375 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lhx5P61375 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lhx5P61375 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lhx5P61375 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lhx5P61375 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lhx5P61375 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lhx5P61375 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lhx5P61375 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lhx5P61375 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lhx5P61375 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lhx5P61375 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lhx5P61375 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lhx5P61375 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lhx5P61375 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Lhx5P61375 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lhx5P61375 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lhx5P61375 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lhx5P61375 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lhx5P61375 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lhx5P61375 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lhx5P61375 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lhx5P61375 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Lhx5P61375 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Lhx5P61375 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lhx5P61375 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lhx5P61375 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lhx5P61375 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lhx5P61375 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lhx5P61375 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lhx5P61375 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lhx5P61375 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lhx5P61375 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms