Protein–RNA interactions for Protein: P61022

Chp1, Calcineurin B homologous protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chp1P61022 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chp1P61022 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chp1P61022 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chp1P61022 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chp1P61022 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chp1P61022 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chp1P61022 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chp1P61022 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chp1P61022 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chp1P61022 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chp1P61022 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chp1P61022 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chp1P61022 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chp1P61022 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chp1P61022 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chp1P61022 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chp1P61022 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chp1P61022 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chp1P61022 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chp1P61022 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chp1P61022 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chp1P61022 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chp1P61022 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chp1P61022 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chp1P61022 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chp1P61022 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chp1P61022 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chp1P61022 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chp1P61022 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chp1P61022 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Chp1P61022 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chp1P61022 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chp1P61022 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chp1P61022 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chp1P61022 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chp1P61022 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chp1P61022 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chp1P61022 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chp1P61022 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chp1P61022 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chp1P61022 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chp1P61022 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chp1P61022 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Chp1P61022 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chp1P61022 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chp1P61022 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chp1P61022 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chp1P61022 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chp1P61022 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chp1P61022 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chp1P61022 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chp1P61022 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chp1P61022 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chp1P61022 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chp1P61022 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chp1P61022 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chp1P61022 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chp1P61022 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chp1P61022 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chp1P61022 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Chp1P61022 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chp1P61022 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chp1P61022 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chp1P61022 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chp1P61022 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chp1P61022 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chp1P61022 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chp1P61022 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Chp1P61022 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Chp1P61022 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chp1P61022 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chp1P61022 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chp1P61022 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chp1P61022 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chp1P61022 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chp1P61022 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chp1P61022 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chp1P61022 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chp1P61022 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chp1P61022 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chp1P61022 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chp1P61022 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chp1P61022 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Chp1P61022 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chp1P61022 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chp1P61022 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chp1P61022 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chp1P61022 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chp1P61022 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chp1P61022 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chp1P61022 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chp1P61022 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Chp1P61022 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chp1P61022 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chp1P61022 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chp1P61022 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chp1P61022 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chp1P61022 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chp1P61022 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chp1P61022 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms