Protein–RNA interactions for Protein: P60824

Cirbp, Cold-inducible RNA-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CirbpP60824 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CirbpP60824 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CirbpP60824 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CirbpP60824 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CirbpP60824 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CirbpP60824 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CirbpP60824 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CirbpP60824 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CirbpP60824 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CirbpP60824 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CirbpP60824 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CirbpP60824 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CirbpP60824 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CirbpP60824 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CirbpP60824 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CirbpP60824 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CirbpP60824 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CirbpP60824 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CirbpP60824 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CirbpP60824 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CirbpP60824 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CirbpP60824 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CirbpP60824 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CirbpP60824 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CirbpP60824 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CirbpP60824 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CirbpP60824 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CirbpP60824 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CirbpP60824 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CirbpP60824 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CirbpP60824 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CirbpP60824 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CirbpP60824 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CirbpP60824 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CirbpP60824 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CirbpP60824 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CirbpP60824 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CirbpP60824 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CirbpP60824 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CirbpP60824 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CirbpP60824 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CirbpP60824 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CirbpP60824 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CirbpP60824 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CirbpP60824 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CirbpP60824 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CirbpP60824 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CirbpP60824 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CirbpP60824 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CirbpP60824 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CirbpP60824 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CirbpP60824 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CirbpP60824 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CirbpP60824 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CirbpP60824 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CirbpP60824 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CirbpP60824 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CirbpP60824 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CirbpP60824 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CirbpP60824 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CirbpP60824 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CirbpP60824 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CirbpP60824 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CirbpP60824 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CirbpP60824 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CirbpP60824 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CirbpP60824 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CirbpP60824 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CirbpP60824 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CirbpP60824 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CirbpP60824 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CirbpP60824 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CirbpP60824 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CirbpP60824 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CirbpP60824 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CirbpP60824 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CirbpP60824 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CirbpP60824 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CirbpP60824 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CirbpP60824 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CirbpP60824 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CirbpP60824 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CirbpP60824 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CirbpP60824 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CirbpP60824 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CirbpP60824 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CirbpP60824 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CirbpP60824 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CirbpP60824 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CirbpP60824 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CirbpP60824 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CirbpP60824 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CirbpP60824 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CirbpP60824 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CirbpP60824 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CirbpP60824 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CirbpP60824 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CirbpP60824 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CirbpP60824 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CirbpP60824 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms