Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ActbP60710 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ActbP60710 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ActbP60710 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ActbP60710 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ActbP60710 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ActbP60710 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ActbP60710 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ActbP60710 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ActbP60710 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ActbP60710 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ActbP60710 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ActbP60710 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ActbP60710 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ActbP60710 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ActbP60710 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ActbP60710 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ActbP60710 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ActbP60710 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ActbP60710 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ActbP60710 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ActbP60710 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ActbP60710 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ActbP60710 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ActbP60710 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ActbP60710 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ActbP60710 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ActbP60710 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ActbP60710 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ActbP60710 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ActbP60710 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ActbP60710 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ActbP60710 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ActbP60710 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ActbP60710 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ActbP60710 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ActbP60710 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ActbP60710 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ActbP60710 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ActbP60710 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ActbP60710 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ActbP60710 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ActbP60710 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ActbP60710 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ActbP60710 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ActbP60710 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ActbP60710 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ActbP60710 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ActbP60710 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ActbP60710 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ActbP60710 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ActbP60710 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ActbP60710 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ActbP60710 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ActbP60710 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ActbP60710 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ActbP60710 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ActbP60710 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ActbP60710 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ActbP60710 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ActbP60710 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ActbP60710 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ActbP60710 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ActbP60710 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ActbP60710 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ActbP60710 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ActbP60710 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ActbP60710 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ActbP60710 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ActbP60710 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ActbP60710 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ActbP60710 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ActbP60710 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ActbP60710 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ActbP60710 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ActbP60710 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ActbP60710 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ActbP60710 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ActbP60710 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ActbP60710 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ActbP60710 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ActbP60710 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ActbP60710 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ActbP60710 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ActbP60710 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ActbP60710 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ActbP60710 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ActbP60710 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ActbP60710 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ActbP60710 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ActbP60710 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ActbP60710 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ActbP60710 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ActbP60710 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ActbP60710 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ActbP60710 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ActbP60710 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ActbP60710 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ActbP60710 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ActbP60710 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms