Protein–RNA interactions for Protein: P59913

Pcmtd1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcmtd1P59913 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcmtd1P59913 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcmtd1P59913 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcmtd1P59913 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcmtd1P59913 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcmtd1P59913 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcmtd1P59913 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcmtd1P59913 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcmtd1P59913 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcmtd1P59913 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcmtd1P59913 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcmtd1P59913 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcmtd1P59913 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcmtd1P59913 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcmtd1P59913 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcmtd1P59913 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcmtd1P59913 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcmtd1P59913 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcmtd1P59913 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcmtd1P59913 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcmtd1P59913 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcmtd1P59913 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcmtd1P59913 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcmtd1P59913 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pcmtd1P59913 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pcmtd1P59913 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pcmtd1P59913 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pcmtd1P59913 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pcmtd1P59913 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pcmtd1P59913 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcmtd1P59913 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcmtd1P59913 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcmtd1P59913 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcmtd1P59913 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcmtd1P59913 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcmtd1P59913 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcmtd1P59913 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcmtd1P59913 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcmtd1P59913 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcmtd1P59913 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcmtd1P59913 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcmtd1P59913 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcmtd1P59913 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcmtd1P59913 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcmtd1P59913 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcmtd1P59913 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcmtd1P59913 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcmtd1P59913 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcmtd1P59913 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcmtd1P59913 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcmtd1P59913 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcmtd1P59913 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcmtd1P59913 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcmtd1P59913 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcmtd1P59913 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcmtd1P59913 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcmtd1P59913 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcmtd1P59913 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcmtd1P59913 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcmtd1P59913 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcmtd1P59913 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcmtd1P59913 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcmtd1P59913 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcmtd1P59913 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcmtd1P59913 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcmtd1P59913 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcmtd1P59913 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcmtd1P59913 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcmtd1P59913 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcmtd1P59913 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcmtd1P59913 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcmtd1P59913 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcmtd1P59913 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcmtd1P59913 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Pcmtd1P59913 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pcmtd1P59913 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pcmtd1P59913 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pcmtd1P59913 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pcmtd1P59913 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pcmtd1P59913 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pcmtd1P59913 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Pcmtd1P59913 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pcmtd1P59913 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pcmtd1P59913 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcmtd1P59913 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcmtd1P59913 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcmtd1P59913 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcmtd1P59913 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcmtd1P59913 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcmtd1P59913 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcmtd1P59913 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcmtd1P59913 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcmtd1P59913 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcmtd1P59913 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcmtd1P59913 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcmtd1P59913 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcmtd1P59913 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcmtd1P59913 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcmtd1P59913 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcmtd1P59913 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms