Protein–RNA interactions for Protein: P59470

Polr3b, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3bP59470 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr3bP59470 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr3bP59470 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr3bP59470 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr3bP59470 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr3bP59470 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr3bP59470 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr3bP59470 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr3bP59470 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr3bP59470 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr3bP59470 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr3bP59470 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr3bP59470 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr3bP59470 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr3bP59470 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr3bP59470 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr3bP59470 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr3bP59470 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr3bP59470 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr3bP59470 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr3bP59470 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Polr3bP59470 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Polr3bP59470 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Polr3bP59470 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Polr3bP59470 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Polr3bP59470 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Polr3bP59470 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Polr3bP59470 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Polr3bP59470 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Polr3bP59470 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Polr3bP59470 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Polr3bP59470 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Polr3bP59470 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Polr3bP59470 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Polr3bP59470 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Polr3bP59470 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Polr3bP59470 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Polr3bP59470 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Polr3bP59470 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Polr3bP59470 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Polr3bP59470 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Polr3bP59470 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Polr3bP59470 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Polr3bP59470 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Polr3bP59470 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Polr3bP59470 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Polr3bP59470 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Polr3bP59470 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Polr3bP59470 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Polr3bP59470 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Polr3bP59470 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Polr3bP59470 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Polr3bP59470 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Polr3bP59470 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Polr3bP59470 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Polr3bP59470 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Polr3bP59470 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Polr3bP59470 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Polr3bP59470 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Polr3bP59470 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Polr3bP59470 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Polr3bP59470 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Polr3bP59470 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Polr3bP59470 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Polr3bP59470 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Polr3bP59470 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Polr3bP59470 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Polr3bP59470 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Polr3bP59470 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Polr3bP59470 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Polr3bP59470 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Polr3bP59470 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Polr3bP59470 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Polr3bP59470 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Polr3bP59470 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Polr3bP59470 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Polr3bP59470 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Polr3bP59470 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Polr3bP59470 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Polr3bP59470 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Polr3bP59470 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Polr3bP59470 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Polr3bP59470 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Polr3bP59470 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Polr3bP59470 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Polr3bP59470 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Polr3bP59470 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Polr3bP59470 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Polr3bP59470 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Polr3bP59470 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Polr3bP59470 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Polr3bP59470 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Polr3bP59470 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Polr3bP59470 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Polr3bP59470 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Polr3bP59470 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Polr3bP59470 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Polr3bP59470 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Polr3bP59470 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Polr3bP59470 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms