Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hps5P59438 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hps5P59438 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hps5P59438 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hps5P59438 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hps5P59438 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hps5P59438 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hps5P59438 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Hps5P59438 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hps5P59438 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hps5P59438 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hps5P59438 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hps5P59438 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hps5P59438 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hps5P59438 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hps5P59438 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hps5P59438 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hps5P59438 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hps5P59438 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hps5P59438 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hps5P59438 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hps5P59438 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hps5P59438 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hps5P59438 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hps5P59438 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hps5P59438 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hps5P59438 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hps5P59438 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hps5P59438 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hps5P59438 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hps5P59438 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hps5P59438 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hps5P59438 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hps5P59438 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Hps5P59438 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hps5P59438 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hps5P59438 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hps5P59438 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hps5P59438 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hps5P59438 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hps5P59438 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hps5P59438 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hps5P59438 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hps5P59438 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hps5P59438 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hps5P59438 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hps5P59438 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hps5P59438 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hps5P59438 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hps5P59438 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hps5P59438 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hps5P59438 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hps5P59438 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hps5P59438 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hps5P59438 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hps5P59438 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hps5P59438 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hps5P59438 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Hps5P59438 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hps5P59438 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hps5P59438 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Hps5P59438 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hps5P59438 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hps5P59438 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hps5P59438 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hps5P59438 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Hps5P59438 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hps5P59438 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hps5P59438 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hps5P59438 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hps5P59438 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hps5P59438 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hps5P59438 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hps5P59438 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hps5P59438 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hps5P59438 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hps5P59438 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hps5P59438 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hps5P59438 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hps5P59438 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hps5P59438 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hps5P59438 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hps5P59438 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Hps5P59438 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hps5P59438 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hps5P59438 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hps5P59438 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hps5P59438 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hps5P59438 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hps5P59438 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hps5P59438 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hps5P59438 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hps5P59438 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hps5P59438 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hps5P59438 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hps5P59438 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hps5P59438 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hps5P59438 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hps5P59438 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hps5P59438 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms