Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scarf2P59222 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scarf2P59222 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scarf2P59222 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scarf2P59222 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scarf2P59222 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scarf2P59222 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scarf2P59222 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scarf2P59222 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scarf2P59222 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scarf2P59222 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scarf2P59222 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scarf2P59222 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scarf2P59222 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scarf2P59222 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scarf2P59222 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scarf2P59222 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Scarf2P59222 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scarf2P59222 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scarf2P59222 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Scarf2P59222 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Scarf2P59222 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scarf2P59222 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scarf2P59222 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scarf2P59222 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scarf2P59222 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scarf2P59222 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scarf2P59222 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scarf2P59222 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scarf2P59222 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scarf2P59222 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scarf2P59222 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scarf2P59222 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scarf2P59222 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Scarf2P59222 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scarf2P59222 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scarf2P59222 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scarf2P59222 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scarf2P59222 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scarf2P59222 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scarf2P59222 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scarf2P59222 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scarf2P59222 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scarf2P59222 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scarf2P59222 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scarf2P59222 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scarf2P59222 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scarf2P59222 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scarf2P59222 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scarf2P59222 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scarf2P59222 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scarf2P59222 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scarf2P59222 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scarf2P59222 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scarf2P59222 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scarf2P59222 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scarf2P59222 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scarf2P59222 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scarf2P59222 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scarf2P59222 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scarf2P59222 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scarf2P59222 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scarf2P59222 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scarf2P59222 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scarf2P59222 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scarf2P59222 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scarf2P59222 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scarf2P59222 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scarf2P59222 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scarf2P59222 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Scarf2P59222 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Scarf2P59222 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scarf2P59222 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scarf2P59222 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scarf2P59222 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scarf2P59222 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scarf2P59222 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scarf2P59222 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scarf2P59222 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scarf2P59222 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scarf2P59222 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scarf2P59222 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scarf2P59222 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Scarf2P59222 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scarf2P59222 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scarf2P59222 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scarf2P59222 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scarf2P59222 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scarf2P59222 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scarf2P59222 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scarf2P59222 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scarf2P59222 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scarf2P59222 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Scarf2P59222 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scarf2P59222 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scarf2P59222 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scarf2P59222 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scarf2P59222 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scarf2P59222 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Scarf2P59222 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms