Protein–RNA interactions for Protein: P59110

Senp1, Sentrin-specific protease 1, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp1P59110 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Senp1P59110 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Senp1P59110 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Senp1P59110 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Senp1P59110 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Senp1P59110 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Senp1P59110 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Senp1P59110 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Senp1P59110 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Senp1P59110 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Senp1P59110 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Senp1P59110 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Senp1P59110 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Senp1P59110 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Senp1P59110 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Senp1P59110 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Senp1P59110 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Senp1P59110 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Senp1P59110 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Senp1P59110 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Senp1P59110 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Senp1P59110 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Senp1P59110 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Senp1P59110 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Senp1P59110 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Senp1P59110 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Senp1P59110 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Senp1P59110 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Senp1P59110 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Senp1P59110 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Senp1P59110 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Senp1P59110 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Senp1P59110 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Senp1P59110 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Senp1P59110 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Senp1P59110 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Senp1P59110 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Senp1P59110 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Senp1P59110 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Senp1P59110 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Senp1P59110 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Senp1P59110 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Senp1P59110 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Senp1P59110 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Senp1P59110 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Senp1P59110 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Senp1P59110 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Senp1P59110 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Senp1P59110 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Senp1P59110 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Senp1P59110 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Senp1P59110 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Senp1P59110 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Senp1P59110 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Senp1P59110 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Senp1P59110 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Senp1P59110 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Senp1P59110 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Senp1P59110 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Senp1P59110 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Senp1P59110 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Senp1P59110 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Senp1P59110 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Senp1P59110 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Senp1P59110 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Senp1P59110 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Senp1P59110 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Senp1P59110 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Senp1P59110 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Senp1P59110 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Senp1P59110 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Senp1P59110 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Senp1P59110 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Senp1P59110 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Senp1P59110 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Senp1P59110 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Senp1P59110 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Senp1P59110 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Senp1P59110 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Senp1P59110 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Senp1P59110 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Senp1P59110 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Senp1P59110 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Senp1P59110 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Senp1P59110 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Senp1P59110 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Senp1P59110 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Senp1P59110 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Senp1P59110 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Senp1P59110 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Senp1P59110 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Senp1P59110 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Senp1P59110 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Senp1P59110 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Senp1P59110 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Senp1P59110 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Senp1P59110 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Senp1P59110 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Senp1P59110 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Senp1P59110 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms