Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctdsp1P58466 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctdsp1P58466 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctdsp1P58466 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctdsp1P58466 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctdsp1P58466 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctdsp1P58466 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctdsp1P58466 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctdsp1P58466 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctdsp1P58466 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctdsp1P58466 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctdsp1P58466 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctdsp1P58466 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctdsp1P58466 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctdsp1P58466 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctdsp1P58466 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctdsp1P58466 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctdsp1P58466 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctdsp1P58466 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctdsp1P58466 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctdsp1P58466 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctdsp1P58466 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctdsp1P58466 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctdsp1P58466 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctdsp1P58466 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctdsp1P58466 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctdsp1P58466 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctdsp1P58466 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctdsp1P58466 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctdsp1P58466 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctdsp1P58466 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctdsp1P58466 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctdsp1P58466 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctdsp1P58466 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctdsp1P58466 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctdsp1P58466 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctdsp1P58466 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctdsp1P58466 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctdsp1P58466 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctdsp1P58466 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctdsp1P58466 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctdsp1P58466 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctdsp1P58466 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctdsp1P58466 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctdsp1P58466 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ctdsp1P58466 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctdsp1P58466 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctdsp1P58466 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctdsp1P58466 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctdsp1P58466 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctdsp1P58466 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctdsp1P58466 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctdsp1P58466 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctdsp1P58466 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctdsp1P58466 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctdsp1P58466 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctdsp1P58466 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctdsp1P58466 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctdsp1P58466 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctdsp1P58466 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctdsp1P58466 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctdsp1P58466 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctdsp1P58466 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctdsp1P58466 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctdsp1P58466 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctdsp1P58466 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctdsp1P58466 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctdsp1P58466 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctdsp1P58466 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctdsp1P58466 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctdsp1P58466 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctdsp1P58466 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctdsp1P58466 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctdsp1P58466 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctdsp1P58466 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctdsp1P58466 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctdsp1P58466 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctdsp1P58466 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctdsp1P58466 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctdsp1P58466 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctdsp1P58466 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctdsp1P58466 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctdsp1P58466 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctdsp1P58466 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctdsp1P58466 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctdsp1P58466 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctdsp1P58466 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctdsp1P58466 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctdsp1P58466 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctdsp1P58466 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctdsp1P58466 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctdsp1P58466 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctdsp1P58466 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctdsp1P58466 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctdsp1P58466 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctdsp1P58466 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctdsp1P58466 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctdsp1P58466 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctdsp1P58466 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctdsp1P58466 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms