Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dpf3P58269 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dpf3P58269 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dpf3P58269 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dpf3P58269 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dpf3P58269 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dpf3P58269 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Dpf3P58269 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Dpf3P58269 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dpf3P58269 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dpf3P58269 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dpf3P58269 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dpf3P58269 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dpf3P58269 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dpf3P58269 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dpf3P58269 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dpf3P58269 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dpf3P58269 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dpf3P58269 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dpf3P58269 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dpf3P58269 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dpf3P58269 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dpf3P58269 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dpf3P58269 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dpf3P58269 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dpf3P58269 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dpf3P58269 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Dpf3P58269 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dpf3P58269 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dpf3P58269 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dpf3P58269 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dpf3P58269 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dpf3P58269 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dpf3P58269 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dpf3P58269 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dpf3P58269 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dpf3P58269 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dpf3P58269 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Dpf3P58269 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dpf3P58269 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dpf3P58269 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dpf3P58269 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dpf3P58269 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dpf3P58269 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dpf3P58269 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dpf3P58269 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Dpf3P58269 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Dpf3P58269 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dpf3P58269 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Dpf3P58269 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dpf3P58269 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dpf3P58269 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dpf3P58269 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dpf3P58269 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dpf3P58269 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dpf3P58269 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Dpf3P58269 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dpf3P58269 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dpf3P58269 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dpf3P58269 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dpf3P58269 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dpf3P58269 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dpf3P58269 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dpf3P58269 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dpf3P58269 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dpf3P58269 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dpf3P58269 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Dpf3P58269 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Dpf3P58269 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dpf3P58269 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dpf3P58269 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dpf3P58269 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dpf3P58269 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dpf3P58269 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dpf3P58269 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dpf3P58269 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dpf3P58269 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dpf3P58269 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dpf3P58269 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Dpf3P58269 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dpf3P58269 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dpf3P58269 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dpf3P58269 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dpf3P58269 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dpf3P58269 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dpf3P58269 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dpf3P58269 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dpf3P58269 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dpf3P58269 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dpf3P58269 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dpf3P58269 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dpf3P58269 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dpf3P58269 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dpf3P58269 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dpf3P58269 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dpf3P58269 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dpf3P58269 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dpf3P58269 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dpf3P58269 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dpf3P58269 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms