Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smpdl3bP58242 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Smpdl3bP58242 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smpdl3bP58242 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smpdl3bP58242 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smpdl3bP58242 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smpdl3bP58242 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smpdl3bP58242 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smpdl3bP58242 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smpdl3bP58242 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smpdl3bP58242 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Smpdl3bP58242 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smpdl3bP58242 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smpdl3bP58242 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smpdl3bP58242 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smpdl3bP58242 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smpdl3bP58242 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Smpdl3bP58242 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smpdl3bP58242 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smpdl3bP58242 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smpdl3bP58242 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smpdl3bP58242 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smpdl3bP58242 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smpdl3bP58242 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Smpdl3bP58242 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smpdl3bP58242 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smpdl3bP58242 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smpdl3bP58242 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smpdl3bP58242 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smpdl3bP58242 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smpdl3bP58242 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Smpdl3bP58242 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smpdl3bP58242 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smpdl3bP58242 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smpdl3bP58242 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smpdl3bP58242 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smpdl3bP58242 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smpdl3bP58242 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smpdl3bP58242 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smpdl3bP58242 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smpdl3bP58242 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smpdl3bP58242 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smpdl3bP58242 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smpdl3bP58242 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smpdl3bP58242 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smpdl3bP58242 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smpdl3bP58242 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smpdl3bP58242 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smpdl3bP58242 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smpdl3bP58242 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smpdl3bP58242 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smpdl3bP58242 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smpdl3bP58242 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smpdl3bP58242 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Smpdl3bP58242 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smpdl3bP58242 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smpdl3bP58242 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smpdl3bP58242 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Smpdl3bP58242 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smpdl3bP58242 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smpdl3bP58242 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smpdl3bP58242 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smpdl3bP58242 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smpdl3bP58242 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smpdl3bP58242 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smpdl3bP58242 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smpdl3bP58242 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smpdl3bP58242 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smpdl3bP58242 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Smpdl3bP58242 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smpdl3bP58242 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smpdl3bP58242 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smpdl3bP58242 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smpdl3bP58242 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smpdl3bP58242 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smpdl3bP58242 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Smpdl3bP58242 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smpdl3bP58242 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smpdl3bP58242 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smpdl3bP58242 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smpdl3bP58242 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smpdl3bP58242 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smpdl3bP58242 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Smpdl3bP58242 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smpdl3bP58242 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smpdl3bP58242 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smpdl3bP58242 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smpdl3bP58242 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smpdl3bP58242 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smpdl3bP58242 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smpdl3bP58242 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smpdl3bP58242 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smpdl3bP58242 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smpdl3bP58242 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Smpdl3bP58242 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smpdl3bP58242 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smpdl3bP58242 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smpdl3bP58242 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Smpdl3bP58242 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Smpdl3bP58242 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms