Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Snrpa1P57784 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Snrpa1P57784 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Snrpa1P57784 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Snrpa1P57784 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Snrpa1P57784 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Snrpa1P57784 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Snrpa1P57784 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Snrpa1P57784 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Snrpa1P57784 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Snrpa1P57784 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Snrpa1P57784 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Snrpa1P57784 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Snrpa1P57784 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Snrpa1P57784 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Snrpa1P57784 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Snrpa1P57784 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Snrpa1P57784 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Snrpa1P57784 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Snrpa1P57784 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Snrpa1P57784 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Snrpa1P57784 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Snrpa1P57784 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Snrpa1P57784 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Snrpa1P57784 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Snrpa1P57784 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Snrpa1P57784 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Snrpa1P57784 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Snrpa1P57784 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Snrpa1P57784 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Snrpa1P57784 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Snrpa1P57784 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Snrpa1P57784 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Snrpa1P57784 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Snrpa1P57784 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Snrpa1P57784 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Snrpa1P57784 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Snrpa1P57784 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Snrpa1P57784 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Snrpa1P57784 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Snrpa1P57784 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Snrpa1P57784 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Snrpa1P57784 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Snrpa1P57784 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Snrpa1P57784 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Snrpa1P57784 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Snrpa1P57784 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Snrpa1P57784 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Snrpa1P57784 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Snrpa1P57784 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Snrpa1P57784 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Snrpa1P57784 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Snrpa1P57784 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Snrpa1P57784 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Snrpa1P57784 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Snrpa1P57784 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Snrpa1P57784 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Snrpa1P57784 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Snrpa1P57784 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Snrpa1P57784 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Snrpa1P57784 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Snrpa1P57784 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Snrpa1P57784 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Snrpa1P57784 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Snrpa1P57784 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Snrpa1P57784 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Snrpa1P57784 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Snrpa1P57784 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Snrpa1P57784 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Snrpa1P57784 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Snrpa1P57784 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Snrpa1P57784 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Snrpa1P57784 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Snrpa1P57784 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Snrpa1P57784 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Snrpa1P57784 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Snrpa1P57784 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Snrpa1P57784 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Snrpa1P57784 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Snrpa1P57784 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Snrpa1P57784 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Snrpa1P57784 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Snrpa1P57784 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Snrpa1P57784 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Snrpa1P57784 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Snrpa1P57784 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Snrpa1P57784 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Snrpa1P57784 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Snrpa1P57784 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Snrpa1P57784 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Snrpa1P57784 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Snrpa1P57784 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Snrpa1P57784 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Snrpa1P57784 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Snrpa1P57784 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Snrpa1P57784 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Snrpa1P57784 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Snrpa1P57784 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Snrpa1P57784 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Snrpa1P57784 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms