Protein–RNA interactions for Protein: P56716

Rp1, Oxygen-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,095 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp1P56716 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rp1P56716 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Rp1P56716 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rp1P56716 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rp1P56716 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rp1P56716 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rp1P56716 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rp1P56716 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rp1P56716 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rp1P56716 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rp1P56716 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rp1P56716 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rp1P56716 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Rp1P56716 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rp1P56716 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rp1P56716 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rp1P56716 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rp1P56716 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rp1P56716 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rp1P56716 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rp1P56716 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rp1P56716 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rp1P56716 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rp1P56716 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Rp1P56716 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rp1P56716 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rp1P56716 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rp1P56716 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rp1P56716 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rp1P56716 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rp1P56716 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rp1P56716 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Rp1P56716 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rp1P56716 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rp1P56716 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rp1P56716 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rp1P56716 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rp1P56716 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rp1P56716 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rp1P56716 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rp1P56716 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rp1P56716 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rp1P56716 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rp1P56716 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rp1P56716 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rp1P56716 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rp1P56716 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rp1P56716 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Rp1P56716 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rp1P56716 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rp1P56716 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Rp1P56716 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rp1P56716 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rp1P56716 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rp1P56716 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rp1P56716 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rp1P56716 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rp1P56716 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rp1P56716 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rp1P56716 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rp1P56716 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rp1P56716 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rp1P56716 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rp1P56716 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rp1P56716 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rp1P56716 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rp1P56716 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rp1P56716 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rp1P56716 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rp1P56716 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rp1P56716 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rp1P56716 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rp1P56716 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Rp1P56716 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Rp1P56716 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rp1P56716 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rp1P56716 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rp1P56716 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rp1P56716 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rp1P56716 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rp1P56716 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rp1P56716 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rp1P56716 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rp1P56716 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rp1P56716 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rp1P56716 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rp1P56716 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rp1P56716 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rp1P56716 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rp1P56716 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rp1P56716 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rp1P56716 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Rp1P56716 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rp1P56716 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rp1P56716 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rp1P56716 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rp1P56716 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rp1P56716 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rp1P56716 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rp1P56716 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms