Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Irf5P56477 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Irf5P56477 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Irf5P56477 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Irf5P56477 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Irf5P56477 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Irf5P56477 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Irf5P56477 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Irf5P56477 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Irf5P56477 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Irf5P56477 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Irf5P56477 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Irf5P56477 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Irf5P56477 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Irf5P56477 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Irf5P56477 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Irf5P56477 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Irf5P56477 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Irf5P56477 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Irf5P56477 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Irf5P56477 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Irf5P56477 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Irf5P56477 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Irf5P56477 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Irf5P56477 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Irf5P56477 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Irf5P56477 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Irf5P56477 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Irf5P56477 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Irf5P56477 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Irf5P56477 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Irf5P56477 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Irf5P56477 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Irf5P56477 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Irf5P56477 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Irf5P56477 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Irf5P56477 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Irf5P56477 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Irf5P56477 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Irf5P56477 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Irf5P56477 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Irf5P56477 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Irf5P56477 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Irf5P56477 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Irf5P56477 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Irf5P56477 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Irf5P56477 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Irf5P56477 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Irf5P56477 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Irf5P56477 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Irf5P56477 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Irf5P56477 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Irf5P56477 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Irf5P56477 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Irf5P56477 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Irf5P56477 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Irf5P56477 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Irf5P56477 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Irf5P56477 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Irf5P56477 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Irf5P56477 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Irf5P56477 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Irf5P56477 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Irf5P56477 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Irf5P56477 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Irf5P56477 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Irf5P56477 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Irf5P56477 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Irf5P56477 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Irf5P56477 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Irf5P56477 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Irf5P56477 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Irf5P56477 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Irf5P56477 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Irf5P56477 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Irf5P56477 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Irf5P56477 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Irf5P56477 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Irf5P56477 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Irf5P56477 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Irf5P56477 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Irf5P56477 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Irf5P56477 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Irf5P56477 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Irf5P56477 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Irf5P56477 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Irf5P56477 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Irf5P56477 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Irf5P56477 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Irf5P56477 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Irf5P56477 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Irf5P56477 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Irf5P56477 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Irf5P56477 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Irf5P56477 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Irf5P56477 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Irf5P56477 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Irf5P56477 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Irf5P56477 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Irf5P56477 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms