Protein–RNA interactions for Protein: P56391

Cox6b1, Cytochrome c oxidase subunit 6B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox6b1P56391 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cox6b1P56391 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cox6b1P56391 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cox6b1P56391 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cox6b1P56391 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cox6b1P56391 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cox6b1P56391 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cox6b1P56391 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cox6b1P56391 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cox6b1P56391 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cox6b1P56391 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cox6b1P56391 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cox6b1P56391 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cox6b1P56391 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cox6b1P56391 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cox6b1P56391 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cox6b1P56391 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cox6b1P56391 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cox6b1P56391 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cox6b1P56391 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cox6b1P56391 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox6b1P56391 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox6b1P56391 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox6b1P56391 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox6b1P56391 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox6b1P56391 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox6b1P56391 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox6b1P56391 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox6b1P56391 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox6b1P56391 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox6b1P56391 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox6b1P56391 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox6b1P56391 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox6b1P56391 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox6b1P56391 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox6b1P56391 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox6b1P56391 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox6b1P56391 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox6b1P56391 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox6b1P56391 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox6b1P56391 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox6b1P56391 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cox6b1P56391 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cox6b1P56391 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cox6b1P56391 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cox6b1P56391 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cox6b1P56391 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cox6b1P56391 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cox6b1P56391 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cox6b1P56391 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cox6b1P56391 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cox6b1P56391 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cox6b1P56391 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cox6b1P56391 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cox6b1P56391 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cox6b1P56391 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cox6b1P56391 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cox6b1P56391 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cox6b1P56391 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cox6b1P56391 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cox6b1P56391 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cox6b1P56391 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cox6b1P56391 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cox6b1P56391 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cox6b1P56391 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cox6b1P56391 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cox6b1P56391 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cox6b1P56391 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cox6b1P56391 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cox6b1P56391 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cox6b1P56391 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cox6b1P56391 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cox6b1P56391 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cox6b1P56391 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cox6b1P56391 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cox6b1P56391 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cox6b1P56391 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox6b1P56391 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox6b1P56391 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox6b1P56391 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox6b1P56391 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox6b1P56391 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox6b1P56391 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox6b1P56391 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox6b1P56391 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox6b1P56391 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox6b1P56391 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox6b1P56391 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox6b1P56391 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox6b1P56391 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox6b1P56391 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox6b1P56391 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox6b1P56391 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox6b1P56391 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox6b1P56391 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cox6b1P56391 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cox6b1P56391 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cox6b1P56391 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox6b1P56391 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox6b1P56391 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms