Protein–RNA interactions for Protein: P56371

Rab4a, Ras-related protein Rab-4A, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab4aP56371 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab4aP56371 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab4aP56371 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab4aP56371 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab4aP56371 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab4aP56371 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab4aP56371 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab4aP56371 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab4aP56371 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab4aP56371 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab4aP56371 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab4aP56371 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab4aP56371 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab4aP56371 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab4aP56371 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab4aP56371 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab4aP56371 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab4aP56371 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab4aP56371 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab4aP56371 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab4aP56371 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab4aP56371 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab4aP56371 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab4aP56371 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab4aP56371 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab4aP56371 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab4aP56371 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab4aP56371 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab4aP56371 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab4aP56371 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab4aP56371 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab4aP56371 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab4aP56371 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab4aP56371 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab4aP56371 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab4aP56371 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab4aP56371 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab4aP56371 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab4aP56371 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab4aP56371 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab4aP56371 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab4aP56371 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab4aP56371 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab4aP56371 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab4aP56371 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab4aP56371 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab4aP56371 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab4aP56371 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab4aP56371 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab4aP56371 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab4aP56371 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab4aP56371 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab4aP56371 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab4aP56371 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab4aP56371 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab4aP56371 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab4aP56371 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab4aP56371 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab4aP56371 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab4aP56371 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab4aP56371 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab4aP56371 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab4aP56371 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab4aP56371 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab4aP56371 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab4aP56371 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab4aP56371 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab4aP56371 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab4aP56371 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab4aP56371 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab4aP56371 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab4aP56371 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab4aP56371 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab4aP56371 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab4aP56371 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab4aP56371 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab4aP56371 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab4aP56371 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab4aP56371 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab4aP56371 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab4aP56371 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab4aP56371 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab4aP56371 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab4aP56371 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab4aP56371 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab4aP56371 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab4aP56371 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab4aP56371 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab4aP56371 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab4aP56371 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab4aP56371 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab4aP56371 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab4aP56371 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab4aP56371 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab4aP56371 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab4aP56371 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab4aP56371 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab4aP56371 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab4aP56371 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab4aP56371 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms